39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2357 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2357  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 241 aa  465  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.865891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3011  SNARE associated Golgi protein  35.53 
 
 		 272 aa  140  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140642 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1002  hypothetical protein  30.34 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2985  SNARE associated Golgi protein  26.61 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0716748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0150  hypothetical protein  27.22 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113557  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0149  hypothetical protein  25.95 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  20.93 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03520  hypothetical protein  27.55 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.130294 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  27.54 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  20.78 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01370  hypothetical protein  25.4 
 
 		 277 aa  62  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.867089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  29.61 
 
 		 234 aa  62  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2397  hypothetical protein  28.16 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  31.98 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  25.71 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  23.83 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  25 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  25 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  25.69 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5151  hypothetical protein  28.06 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  24.61 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  28.08 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  26.17 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  23.66 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  23.66 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  32.26 
 
 		 174 aa  42.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  25.18 
 
 		 226 aa  42.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1727  SNARE associated Golgi protein  24.05 
 
 		 189 aa  42  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  29.58 
 
 		 234 aa  42  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  32.43 
 
 		 159 aa  41.6  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  29.45 
 
 		 234 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1052  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.04 
 
 		 243 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167125  normal  0.137944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>