69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3177 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3177  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
221 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1879  SNARE associated Golgi protein  45.83 
 
 
218 aa  171  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302356  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  34.33 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  28.71 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  32.52 
 
 
194 aa  58.9  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  28.57 
 
 
236 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  28.57 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  28.57 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  28.57 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.57 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  28.57 
 
 
236 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  29.59 
 
 
202 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.57 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  28.38 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  28.57 
 
 
202 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  30 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  28.15 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  31.65 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  29.2 
 
 
231 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  29.2 
 
 
231 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.09 
 
 
218 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3768  SNARE associated Golgi protein  28.07 
 
 
220 aa  48.9  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.543637 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4044  SNARE associated Golgi protein  28.07 
 
 
220 aa  48.9  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.786736  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  27.78 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  27.78 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  27.78 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  27.78 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  27.78 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  27.78 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  27.78 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  28 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  29.73 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  25.9 
 
 
724 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 
267 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.04 
 
 
717 aa  46.2  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3864  SNARE associated Golgi protein  27.42 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  24 
 
 
232 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  25.5 
 
 
235 aa  46.2  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5607  hypothetical protein  27.22 
 
 
220 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352858  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5315  hypothetical protein  27.22 
 
 
220 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5227  hypothetical protein  27.22 
 
 
220 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  25.5 
 
 
235 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  25.5 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  25.5 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  25.5 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  25.5 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2222  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.81 
 
 
200 aa  45.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  25.5 
 
 
235 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.5 
 
 
235 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  25.93 
 
 
259 aa  45.1  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  25.5 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  30.92 
 
 
325 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  29.81 
 
 
717 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  24.7 
 
 
252 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0857  SNARE associated Golgi protein  25.4 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0125734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  27.93 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  27.04 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  29.05 
 
 
246 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  24.79 
 
 
197 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  27.73 
 
 
714 aa  42.4  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  30.1 
 
 
229 aa  42  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.13 
 
 
713 aa  42  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  25.26 
 
 
717 aa  42  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  31.09 
 
 
225 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 
237 aa  41.6  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  25.45 
 
 
246 aa  41.6  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>