137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0113 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0113  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  441  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0467545 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3883  hypothetical protein  69.41 
 
 		 219 aa  309  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4271  SNARE associated Golgi protein  70.14 
 
 		 221 aa  309  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4086  hypothetical protein  69.41 
 
 		 219 aa  310  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4466  SNARE associated Golgi protein  70.14 
 
 		 221 aa  309  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3976  hypothetical protein  69.41 
 
 		 219 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.417481 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4326  SNARE associated Golgi protein  70.14 
 
 		 221 aa  308  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4689  hypothetical protein  68.95 
 
 		 219 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4105  SNARE associated Golgi protein  50 
 
 		 221 aa  224  7e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0283  hypothetical protein  50.7 
 
 		 222 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.3415  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0758  SNARE associated Golgi protein  39.79 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.826687 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1172  hypothetical protein  34.87 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0907019  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1595  hypothetical protein  34.07 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3675  hypothetical protein  35.2 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00383  hypothetical protein  32.69 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0135  hypothetical protein  37.57 
 
 		 250 aa  132  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0073  hypothetical protein  61.54 
 
 		 106 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2048  SNARE associated Golgi protein  43.11 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0975  hypothetical protein  43.97 
 
 		 210 aa  112  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1535  hypothetical protein  41.76 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03390  hypothetical protein  35.08 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1112  hypothetical protein  35.23 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 		 714 aa  68.6  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  29.05 
 
 		 713 aa  62.4  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  31.3 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  31.25 
 
 		 714 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3057  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000815606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  31.53 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  29.25 
 
 		 717 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  22.27 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  28.36 
 
 		 720 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  22.86 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  27.34 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  27.41 
 
 		 738 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  24 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  25.93 
 
 		 735 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  26.94 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  27.37 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  32.31 
 
 		 722 aa  55.5  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  25.53 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  27.75 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  23.2 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  29.77 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  29.03 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  29.71 
 
 		 240 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  33.02 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  31.96 
 
 		 735 aa  52  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  32.58 
 
 		 267 aa  52  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  27.34 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  28.24 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  28 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  26.49 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  26.73 
 
 		 746 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  25.95 
 
 		 704 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  28.57 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  29.69 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  23.12 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  27.54 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  25.27 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  28.32 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  30.34 
 
 		 716 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  25.9 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2421  hypothetical protein  34.41 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  28.4 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  26.87 
 
 		 732 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.95 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  26.87 
 
 		 732 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  29.06 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  26.87 
 
 		 732 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  29.06 
 
 		 236 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  29.06 
 
 		 236 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.99 
 
 		 717 aa  48.5  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  25.33 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  30.57 
 
 		 714 aa  48.9  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  29.06 
 
 		 236 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  30.77 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  25.87 
 
 		 238 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  29 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.54 
 
 		 722 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  27.69 
 
 		 738 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  29.5 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  32.2 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.08 
 
 		 722 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.81 
 
 		 713 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.66 
 
 		 705 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  28.36 
 
 		 716 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  29 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 282 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  28.32 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3144  hypothetical protein  29.32 
 
 		 271 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 282 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  23.93 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  26.5 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  21.62 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.77 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  33.78 
 
 		 728 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  31.53 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>