160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4326 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_4326  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 221 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4271  SNARE associated Golgi protein  99.1 
 
 		 221 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4466  SNARE associated Golgi protein  99.1 
 
 		 221 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3883  hypothetical protein  89.04 
 
 		 219 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3976  hypothetical protein  89.5 
 
 		 219 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.417481 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4086  hypothetical protein  89.04 
 
 		 219 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4689  hypothetical protein  84.86 
 
 		 219 aa  367  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0113  hypothetical protein  70.14 
 
 		 225 aa  297  9e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0467545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4105  SNARE associated Golgi protein  53.18 
 
 		 221 aa  236  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0283  hypothetical protein  49.74 
 
 		 222 aa  175  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.3415  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0073  hypothetical protein  95.19 
 
 		 106 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0758  SNARE associated Golgi protein  38.89 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.826687 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1172  hypothetical protein  37.44 
 
 		 226 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0907019  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3675  hypothetical protein  35.23 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1595  hypothetical protein  34.38 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00383  hypothetical protein  36.56 
 
 		 238 aa  135  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0135  hypothetical protein  40.52 
 
 		 250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1535  hypothetical protein  41.36 
 
 		 234 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2048  SNARE associated Golgi protein  35.39 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03390  hypothetical protein  32.26 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0975  hypothetical protein  38 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1112  hypothetical protein  33.78 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  41.07 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  31.37 
 
 		 713 aa  68.9  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  32.08 
 
 		 714 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  28.44 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  25.23 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  24.09 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  27.89 
 
 		 267 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  35.4 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  29.27 
 
 		 717 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  32.79 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  25.93 
 
 		 735 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  32.33 
 
 		 226 aa  62  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  29.77 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  32.8 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  26.7 
 
 		 738 aa  60.1  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  31.43 
 
 		 714 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  23.87 
 
 		 714 aa  58.9  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  34.4 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  34.38 
 
 		 722 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  26.89 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 		 735 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  29.41 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.9 
 
 		 701 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  24.45 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  28.19 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  23.6 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.18 
 
 		 746 aa  55.5  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  26.57 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  30 
 
 		 803 aa  55.1  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  26.89 
 
 		 720 aa  55.1  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.33 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  32.74 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  26.7 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  28.66 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  28.45 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  32.73 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  25.87 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  26.85 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.66 
 
 		 722 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  21.2 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  31.86 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  27.27 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  28.88 
 
 		 623 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  28.29 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3144  hypothetical protein  28.42 
 
 		 271 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  31.43 
 
 		 724 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  30.71 
 
 		 738 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  28.17 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  29.45 
 
 		 282 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  31.97 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  31.03 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  28.72 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  31.09 
 
 		 282 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  30.6 
 
 		 716 aa  52.4  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.34 
 
 		 722 aa  52  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  33.58 
 
 		 259 aa  52  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.33 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  31.3 
 
 		 716 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  27.01 
 
 		 325 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  28.46 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  29.47 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  28.1 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  28.66 
 
 		 717 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3057  SNARE associated Golgi protein  30.84 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000815606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  26.51 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  29.47 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  27.1 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.1 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30 
 
 		 712 aa  49.7  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  29.77 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  27.21 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  27.1 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  27.1 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  27.1 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  27.1 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  27.1 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  27.03 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  28.17 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>