90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03390 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03390  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  442  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0113  hypothetical protein  36.31 
 
 		 225 aa  105  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0467545 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0758  SNARE associated Golgi protein  35.09 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.826687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4326  SNARE associated Golgi protein  31.03 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4466  SNARE associated Golgi protein  31.03 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4271  SNARE associated Golgi protein  31.03 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3976  hypothetical protein  31.64 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.417481 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4086  hypothetical protein  31.07 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3883  hypothetical protein  31.07 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1172  hypothetical protein  36.36 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0907019  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1595  hypothetical protein  34.72 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00383  hypothetical protein  29.83 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4689  hypothetical protein  29.38 
 
 		 219 aa  88.6  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2048  SNARE associated Golgi protein  37.66 
 
 		 243 aa  88.2  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0135  hypothetical protein  33.54 
 
 		 250 aa  85.5  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0975  hypothetical protein  33.91 
 
 		 210 aa  85.1  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4105  SNARE associated Golgi protein  29.53 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0283  hypothetical protein  32.77 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.3415  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3675  hypothetical protein  32.79 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1535  hypothetical protein  29.7 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  28.26 
 
 		 735 aa  62  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  25.32 
 
 		 714 aa  61.6  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  27.73 
 
 		 717 aa  60.1  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  26.55 
 
 		 714 aa  59.3  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.41 
 
 		 713 aa  59.3  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  28.39 
 
 		 724 aa  58.2  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  25.41 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  30.97 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  29.22 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  30.43 
 
 		 714 aa  56.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  27.7 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  26 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  30.37 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  25.55 
 
 		 746 aa  52.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  25.47 
 
 		 730 aa  52  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  23.3 
 
 		 701 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 		 282 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 		 282 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  27.81 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  26.63 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  24.67 
 
 		 720 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  28.69 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  24.22 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  28.38 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  28.69 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  25.9 
 
 		 738 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  32.98 
 
 		 735 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2018  hypothetical protein  25.16 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1112  hypothetical protein  29.6 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  28.57 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  30.77 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  26.76 
 
 		 264 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  23.19 
 
 		 738 aa  48.9  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  30.25 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  32.28 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  22.16 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  27.5 
 
 		 174 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  27.15 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  27.62 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3144  hypothetical protein  31.03 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  24.58 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  27.42 
 
 		 739 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  27.42 
 
 		 739 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  23.49 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  28.99 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  28.99 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  28.99 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  23.68 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1052  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.34 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167125  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  23.93 
 
 		 252 aa  45.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  22.73 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  25.16 
 
 		 716 aa  45.1  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  22.73 
 
 		 209 aa  45.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  24.55 
 
 		 722 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.49 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  30 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 732 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 732 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  26.72 
 
 		 325 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 732 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  30.48 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  30.48 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  30.43 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  25.5 
 
 		 717 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5116  SNARE associated Golgi protein  22.95 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0230312  hitchhiker  0.00408274 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  26.72 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.35 
 
 		 722 aa  42.7  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  27.73 
 
 		 226 aa  42  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  31.62 
 
 		 232 aa  41.6  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>