181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3450 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3450  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 251 aa  475  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3224  hypothetical protein  85.6 
 
 		 264 aa  324  8.000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4825  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.42 
 
 		 247 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  36.57 
 
 		 239 aa  89.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  38.56 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  33.01 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  29.44 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  29.44 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  30.86 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  33.13 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  30.86 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.86 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  30.86 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  30.86 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  30.86 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  30.86 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  30.86 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  31.48 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  27.42 
 
 		 224 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  31.54 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  31.54 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  28.57 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  35 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  32.6 
 
 		 714 aa  69.7  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.54 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  29.61 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  29.94 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  34.69 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 		 325 aa  68.6  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  33.76 
 
 		 714 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2048  SNARE associated Golgi protein  31.16 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2222  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.43 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.7 
 
 		 701 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  32.75 
 
 		 320 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1181  hypothetical protein  36.84 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.339336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  29.87 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  34.13 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  28.25 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  31.33 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  24.52 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  30.72 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  28.95 
 
 		 735 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0758  SNARE associated Golgi protein  28.14 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.826687 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  28.39 
 
 		 738 aa  62.4  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  26.11 
 
 		 252 aa  62  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  28.04 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.09 
 
 		 713 aa  61.6  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  34.53 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  32.19 
 
 		 735 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  30.92 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  34 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1172  hypothetical protein  28.82 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0907019  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  26.5 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  32.41 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  22.46 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.03 
 
 		 746 aa  58.9  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10636  transmembrane protein  34.88 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238726  normal  0.438888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  25.95 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  32.43 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  26.97 
 
 		 623 aa  58.5  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  28.29 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  31.41 
 
 		 746 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2103  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.26 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0975  hypothetical protein  31.62 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 		 722 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  30.86 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.09 
 
 		 717 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0283  hypothetical protein  31.36 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.3415  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.49 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.57 
 
 		 722 aa  57  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  22.35 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5116  SNARE associated Golgi protein  32.17 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0230312  hitchhiker  0.00408274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  26.75 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00383  hypothetical protein  24.29 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  31.65 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  28.91 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  31.61 
 
 		 732 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  31.61 
 
 		 732 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  31.61 
 
 		 732 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  32 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  30.95 
 
 		 724 aa  55.5  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1052  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.5 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167125  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5227  hypothetical protein  35 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  29.66 
 
 		 720 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.47 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5315  hypothetical protein  35 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5607  hypothetical protein  35 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352858  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  30.36 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  27.89 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5151  hypothetical protein  32.89 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  31.97 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.51 
 
 		 705 aa  53.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  26.82 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  28.3 
 
 		 717 aa  52.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  27.01 
 
 		 714 aa  52.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  25.77 
 
 		 266 aa  52.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.08 
 
 		 217 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>