42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2511 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2511  SNARE associated Golgi protein-related protein  100 
 
 		 264 aa  478  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  26.49 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  38.89 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.91 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  29.1 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  31.75 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1435  SNARE associated Golgi protein  25.16 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000156702  decreased coverage  0.000261969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  30.87 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  24.03 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2222  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.89 
 
 		 200 aa  49.3  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  29.53 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  29.53 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  26.15 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  26.67 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.67 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  30.08 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0210  hypothetical protein  28.57 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  28.77 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  30.08 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  26.15 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  26.15 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  26.15 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  27.14 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  30.08 
 
 		 235 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.08 
 
 		 235 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  30.08 
 
 		 235 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  30.08 
 
 		 235 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  30.08 
 
 		 235 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  30.08 
 
 		 235 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.52 
 
 		 713 aa  45.8  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  30.6 
 
 		 267 aa  45.4  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  26.15 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  27.93 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  24.55 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1596  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.88 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  26.75 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0866  DedA family protein  24.22 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000043469  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  30.18 
 
 		 224 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  27.97 
 
 		 216 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  24.18 
 
 		 208 aa  43.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1879  SNARE associated Golgi protein  26.27 
 
 		 218 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302356  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  29.73 
 
 		 235 aa  42  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>