180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2728 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  93.29 
 
 		 507 aa  964    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 507 aa  1053    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  34.65 
 
 		 735 aa  259  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  34.97 
 
 		 717 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  30.22 
 
 		 714 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  32.58 
 
 		 714 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  34.09 
 
 		 730 aa  239  9e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  32.66 
 
 		 728 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  32.6 
 
 		 728 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.75 
 
 		 701 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  30.59 
 
 		 732 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  31.93 
 
 		 739 aa  223  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  31.71 
 
 		 525 aa  223  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  30.89 
 
 		 732 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  30.89 
 
 		 732 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  31.73 
 
 		 739 aa  220  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  31.53 
 
 		 746 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.18 
 
 		 502 aa  217  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  33.1 
 
 		 502 aa  216  9e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.99 
 
 		 498 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  31.66 
 
 		 512 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  32.94 
 
 		 483 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  32.39 
 
 		 714 aa  208  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  31.76 
 
 		 498 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  29.19 
 
 		 720 aa  207  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  31.53 
 
 		 483 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  33.2 
 
 		 478 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.53 
 
 		 713 aa  204  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  32.94 
 
 		 735 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  28.21 
 
 		 491 aa  200  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  30.16 
 
 		 504 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  30.53 
 
 		 518 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  32.95 
 
 		 572 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.02 
 
 		 474 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.25 
 
 		 504 aa  197  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  29.51 
 
 		 724 aa  196  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  32.57 
 
 		 482 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  30.66 
 
 		 517 aa  193  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.67 
 
 		 521 aa  193  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  29.88 
 
 		 738 aa  190  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  32.37 
 
 		 504 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  28.35 
 
 		 803 aa  171  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  29.29 
 
 		 510 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.94 
 
 		 514 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.98 
 
 		 503 aa  153  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.62 
 
 		 517 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  31.82 
 
 		 515 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.96 
 
 		 513 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  26.48 
 
 		 470 aa  114  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.81 
 
 		 546 aa  95.9  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  27.3 
 
 		 510 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  27.62 
 
 		 533 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  27.01 
 
 		 516 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  27.01 
 
 		 516 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.74 
 
 		 465 aa  80.5  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.15 
 
 		 544 aa  77  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  23.39 
 
 		 676 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3563  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.33 
 
 		 497 aa  73.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  26.94 
 
 		 734 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  26.94 
 
 		 754 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  26.94 
 
 		 754 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  26.1 
 
 		 512 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  29.17 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.39 
 
 		 632 aa  67.4  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0906  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.07 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.811495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  23.7 
 
 		 681 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  26.48 
 
 		 533 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.92 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.69 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  22.65 
 
 		 1821 aa  60.8  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  20.76 
 
 		 1522 aa  60.5  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12431  predicted protein  23.11 
 
 		 801 aa  60.5  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  41.05 
 
 		 684 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2067  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.7 
 
 		 536 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.800822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.86 
 
 		 382 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0386  phospholipase D/transphosphatidylase  22.79 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  23.64 
 
 		 524 aa  58.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  25.6 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.15 
 
 		 481 aa  57.4  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  24.28 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  24.24 
 
 		 480 aa  57  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  24.28 
 
 		 476 aa  56.6  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.63 
 
 		 483 aa  56.6  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.28 
 
 		 476 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 482 aa  56.6  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.41 
 
 		 486 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  34.29 
 
 		 684 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4175  phospholipase D/transphosphatidylase  27.15 
 
 		 668 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  25.25 
 
 		 477 aa  54.3  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0392  phospholipase D/transphosphatidylase  21.83 
 
 		 780 aa  53.5  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.53 
 
 		 478 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  19.27 
 
 		 508 aa  52.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  22.01 
 
 		 502 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1387  cardiolipin synthetase 2  26.01 
 
 		 477 aa  52.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  24.17 
 
 		 481 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03737  phospholipase protein  45.1 
 
 		 652 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  23.76 
 
 		 476 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  24.17 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.34 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  24.18 
 
 		 490 aa  52  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>