More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0106 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  93.23 
 
 		 502 aa  954    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 502 aa  1017    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  54.13 
 
 		 483 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  54.13 
 
 		 498 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  52.71 
 
 		 483 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.65 
 
 		 521 aa  438  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  50.32 
 
 		 491 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.8 
 
 		 504 aa  425  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  47.36 
 
 		 525 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  43.92 
 
 		 504 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  45.16 
 
 		 512 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  45.2 
 
 		 482 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  43.12 
 
 		 714 aa  365  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.77 
 
 		 498 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  43.92 
 
 		 504 aa  362  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  40.7 
 
 		 714 aa  361  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  45.38 
 
 		 714 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  40.47 
 
 		 717 aa  340  4e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  40.43 
 
 		 735 aa  336  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.11 
 
 		 474 aa  329  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  41.11 
 
 		 518 aa  329  8e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.13 
 
 		 701 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  43.29 
 
 		 478 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  39.58 
 
 		 732 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  39.58 
 
 		 732 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  39.45 
 
 		 739 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  39.24 
 
 		 739 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  39.58 
 
 		 732 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  38.69 
 
 		 724 aa  314  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  38.06 
 
 		 510 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  37.74 
 
 		 746 aa  299  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  40.05 
 
 		 517 aa  299  7e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  39.11 
 
 		 735 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  37.58 
 
 		 803 aa  297  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  37.84 
 
 		 572 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.27 
 
 		 503 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  38.85 
 
 		 728 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  35 
 
 		 514 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.79 
 
 		 713 aa  271  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  38.43 
 
 		 728 aa  269  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  40.55 
 
 		 515 aa  264  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.92 
 
 		 517 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.7 
 
 		 513 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  30.53 
 
 		 730 aa  251  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  31.4 
 
 		 720 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.1 
 
 		 507 aa  216  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  30.25 
 
 		 738 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.74 
 
 		 507 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  28.71 
 
 		 470 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  28.39 
 
 		 533 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.09 
 
 		 546 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  29.47 
 
 		 533 aa  90.1  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  27.06 
 
 		 512 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.38 
 
 		 465 aa  86.7  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  23.31 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  29.96 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  27.41 
 
 		 516 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  27.41 
 
 		 510 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  27.41 
 
 		 516 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  26.4 
 
 		 1821 aa  80.1  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  31.39 
 
 		 754 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  31.39 
 
 		 754 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  31.39 
 
 		 734 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.3 
 
 		 486 aa  75.5  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  23.45 
 
 		 1783 aa  75.1  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  23.6 
 
 		 480 aa  73.6  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.73 
 
 		 632 aa  71.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  24.18 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  24.18 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  26.91 
 
 		 502 aa  70.5  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  25.68 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  27.8 
 
 		 505 aa  70.1  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  22.47 
 
 		 1522 aa  69.7  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2057  cardiolipin synthetase 2  28.16 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.830575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  23.2 
 
 		 509 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  23.84 
 
 		 509 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  23.86 
 
 		 509 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  23.86 
 
 		 509 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  23.92 
 
 		 509 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  23.86 
 
 		 509 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  23.33 
 
 		 509 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  25.45 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  23.08 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  27.24 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.08 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  26.76 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.99 
 
 		 487 aa  67  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  27.57 
 
 		 524 aa  67  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  25 
 
 		 541 aa  67  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  25.37 
 
 		 479 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12431  predicted protein  23.73 
 
 		 801 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  23.13 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.62 
 
 		 487 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2067  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.96 
 
 		 536 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.800822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  26.89 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4057  cardiolipin synthetase  27.74 
 
 		 518 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  23.95 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1291  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.84 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  24.9 
 
 		 479 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  24.09 
 
 		 502 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>