83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0392 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0392  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 780 aa  1612    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  39.93 
 
 		 818 aa  513  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18970  phospholipase D  35.29 
 
 		 1103 aa  310  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000786782  normal  0.317995 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  29.44 
 
 		 1783 aa  181  4e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  28.78 
 
 		 1821 aa  167  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  26.99 
 
 		 1522 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12431  predicted protein  24.39 
 
 		 801 aa  114  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06712  Phospholipase D [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F2]  23.12 
 
 		 833 aa  95.9  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355255  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02586  conserved hypothetical protein  22.3 
 
 		 759 aa  93.2  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.500425  normal  0.391279 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0398  phospholipase D/transphosphatidylase  47.57 
 
 		 270 aa  88.2  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01480  phospholipase D, putative  25.54 
 
 		 775 aa  79.7  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07334  phospholipase D (PLD), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16520)  36.48 
 
 		 1219 aa  72.8  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  30.36 
 
 		 728 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  32.67 
 
 		 728 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  33.56 
 
 		 739 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  30.19 
 
 		 746 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  30.82 
 
 		 732 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  30.82 
 
 		 732 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  30.82 
 
 		 732 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  33.56 
 
 		 739 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.65 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  30.92 
 
 		 724 aa  61.6  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  30 
 
 		 735 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  21.43 
 
 		 730 aa  61.2  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  25.91 
 
 		 518 aa  60.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  24.14 
 
 		 681 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  32.28 
 
 		 735 aa  58.9  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.08 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.68 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 		 714 aa  57.4  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  29.14 
 
 		 714 aa  56.2  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  24.84 
 
 		 676 aa  55.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  28.87 
 
 		 517 aa  55.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  27.33 
 
 		 720 aa  55.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  23.87 
 
 		 525 aa  55.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  29.49 
 
 		 510 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.34 
 
 		 701 aa  54.7  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  28.1 
 
 		 533 aa  54.3  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.83 
 
 		 507 aa  53.5  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.19 
 
 		 507 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  28.77 
 
 		 714 aa  52.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  26.88 
 
 		 533 aa  51.6  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_003296  RS03737  phospholipase protein  22.99 
 
 		 652 aa  50.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.87 
 
 		 474 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  25.44 
 
 		 504 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  24.54 
 
 		 512 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  25.89 
 
 		 502 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  29.93 
 
 		 479 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.89 
 
 		 502 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  26.32 
 
 		 738 aa  49.3  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  24.09 
 
 		 470 aa  49.3  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  26.45 
 
 		 572 aa  48.1  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  27.63 
 
 		 416 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.66 
 
 		 498 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3860  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.34 
 
 		 691 aa  47  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  24.85 
 
 		 417 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  53.66 
 
 		 684 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  28.39 
 
 		 451 aa  47  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  22.5 
 
 		 491 aa  47.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  24.43 
 
 		 486 aa  46.2  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  28.21 
 
 		 516 aa  47  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  28.21 
 
 		 516 aa  47  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  31.72 
 
 		 803 aa  46.6  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  52.17 
 
 		 745 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  48.89 
 
 		 655 aa  45.8  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080409 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.11 
 
 		 521 aa  45.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.03 
 
 		 632 aa  45.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  25.53 
 
 		 477 aa  45.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  28.57 
 
 		 479 aa  45.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  28.57 
 
 		 479 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2285  cardiolipin synthase 2  29.71 
 
 		 400 aa  45.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0421896  hitchhiker  0.000113345 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  28.57 
 
 		 479 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  28.57 
 
 		 479 aa  45.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  28.57 
 
 		 479 aa  44.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  28.57 
 
 		 479 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  28.57 
 
 		 479 aa  45.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  26.12 
 
 		 478 aa  44.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  52.63 
 
 		 684 aa  44.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  24.82 
 
 		 441 aa  44.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  26.29 
 
 		 401 aa  44.3  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  57.58 
 
 		 524 aa  44.3  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  23.74 
 
 		 486 aa  44.3  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3264  cardiolipin synthase 2  25.42 
 
 		 400 aa  43.9  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>