134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5129 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  76.07 
 
 		 514 aa  797    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 503 aa  1022    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  48.3 
 
 		 572 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  45.98 
 
 		 517 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  46.17 
 
 		 478 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.78 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  40.13 
 
 		 518 aa  339  8e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.99 
 
 		 521 aa  310  5e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  40.88 
 
 		 714 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  38.92 
 
 		 491 aa  292  9e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  40.52 
 
 		 739 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.87 
 
 		 701 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  41 
 
 		 714 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  36.27 
 
 		 502 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  40.3 
 
 		 739 aa  282  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.41 
 
 		 502 aa  280  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  39.87 
 
 		 732 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  39.87 
 
 		 732 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  35.84 
 
 		 735 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  39.44 
 
 		 732 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.25 
 
 		 504 aa  272  8.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  37.53 
 
 		 483 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  37.53 
 
 		 498 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  35.24 
 
 		 525 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  38.39 
 
 		 483 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.47 
 
 		 498 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  35.75 
 
 		 714 aa  264  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  35.06 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  36.11 
 
 		 724 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  36.54 
 
 		 717 aa  259  9e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  34.42 
 
 		 512 aa  259  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  35.99 
 
 		 735 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  37.89 
 
 		 504 aa  253  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  40.4 
 
 		 746 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.31 
 
 		 713 aa  245  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  35.79 
 
 		 803 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  39.61 
 
 		 728 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  39.61 
 
 		 728 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  32.46 
 
 		 510 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  37.39 
 
 		 482 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  40.33 
 
 		 515 aa  225  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  40 
 
 		 517 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.33 
 
 		 513 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  30.48 
 
 		 730 aa  203  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  30.21 
 
 		 720 aa  187  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  27.36 
 
 		 738 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.98 
 
 		 507 aa  153  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.12 
 
 		 507 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  26.94 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  29.8 
 
 		 533 aa  90.1  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  27.04 
 
 		 512 aa  74.3  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 		 734 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  28.52 
 
 		 754 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  28.52 
 
 		 754 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.44 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  27.46 
 
 		 533 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.93 
 
 		 546 aa  66.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  27.66 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  24.68 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0392  phospholipase D/transphosphatidylase  32.65 
 
 		 780 aa  65.1  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07334  phospholipase D (PLD), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16520)  25.47 
 
 		 1219 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  27.55 
 
 		 516 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  27.55 
 
 		 516 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  28.32 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.78 
 
 		 632 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  27.39 
 
 		 1522 aa  57.4  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02586  conserved hypothetical protein  21.93 
 
 		 759 aa  57  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.500425  normal  0.391279 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  22.75 
 
 		 1821 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  22.76 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  24.35 
 
 		 485 aa  55.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  22.53 
 
 		 1783 aa  53.5  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  23.78 
 
 		 502 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  24 
 
 		 544 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  24.09 
 
 		 479 aa  52.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  25.36 
 
 		 537 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  34.35 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.26 
 
 		 477 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.53 
 
 		 481 aa  52  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.91 
 
 		 476 aa  52  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  27.59 
 
 		 818 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2067  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.07 
 
 		 536 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.800822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  26.03 
 
 		 487 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  25.07 
 
 		 474 aa  51.2  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3370  phospholipase D/transphosphatidylase  27.34 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.187566  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  23.85 
 
 		 495 aa  51.2  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  22.68 
 
 		 486 aa  51.2  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06712  Phospholipase D [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F2]  25.25 
 
 		 833 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355255  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03737  phospholipase protein  35.37 
 
 		 652 aa  50.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  21.6 
 
 		 482 aa  50.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  23.73 
 
 		 477 aa  50.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  35.37 
 
 		 684 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3563  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  23.44 
 
 		 497 aa  50.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  22.38 
 
 		 681 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  21.37 
 
 		 509 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  23.04 
 
 		 484 aa  47.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  25.19 
 
 		 478 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  23.95 
 
 		 467 aa  47.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  21.41 
 
 		 483 aa  47.4  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3516  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.59 
 
 		 417 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0666104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3452  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.59 
 
 		 417 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>