83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND05920 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  52.29 
 
 
1821 aa  801    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  100 
 
 
1522 aa  3166    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  45.73 
 
 
1783 aa  663    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06712  Phospholipase D [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F2]  41.46 
 
 
833 aa  345  4e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355255  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01480  phospholipase D, putative  41.75 
 
 
775 aa  308  5.0000000000000004e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02586  conserved hypothetical protein  36.34 
 
 
759 aa  294  1e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.500425  normal  0.391279 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07334  phospholipase D (PLD), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16520)  41.84 
 
 
1219 aa  228  6e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  26.69 
 
 
818 aa  178  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0392  phospholipase D/transphosphatidylase  26.99 
 
 
780 aa  148  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12431  predicted protein  24.81 
 
 
801 aa  114  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  25.05 
 
 
470 aa  103  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  24.55 
 
 
701 aa  102  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  26.79 
 
 
714 aa  101  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.37 
 
 
498 aa  95.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  22.2 
 
 
517 aa  89.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  24.31 
 
 
720 aa  89.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  23.3 
 
 
504 aa  87.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  23.8 
 
 
525 aa  87  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  23.68 
 
 
510 aa  87  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  24.24 
 
 
512 aa  86.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18970  phospholipase D  42.27 
 
 
1103 aa  86.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000786782  normal  0.317995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  24.85 
 
 
714 aa  85.5  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  23.81 
 
 
491 aa  84.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  23.55 
 
 
572 aa  83.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  23.4 
 
 
516 aa  79  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  23.4 
 
 
516 aa  79  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  21.93 
 
 
746 aa  79  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  23.36 
 
 
739 aa  78.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  24.63 
 
 
512 aa  77.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  26.37 
 
 
735 aa  76.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  22.07 
 
 
732 aa  77  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  24.12 
 
 
717 aa  76.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  23.37 
 
 
504 aa  76.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  21.86 
 
 
732 aa  76.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  21.86 
 
 
732 aa  76.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  23.16 
 
 
739 aa  75.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  27.84 
 
 
518 aa  74.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.11 
 
 
465 aa  74.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.25 
 
 
514 aa  73.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.57 
 
 
504 aa  71.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  21.39 
 
 
738 aa  71.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  22.47 
 
 
502 aa  69.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  25.81 
 
 
730 aa  69.3  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.52 
 
 
502 aa  69.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0398  phospholipase D/transphosphatidylase  54.39 
 
 
270 aa  68.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  21.62 
 
 
533 aa  68.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.26 
 
 
521 aa  67.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  22.98 
 
 
510 aa  66.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  24.88 
 
 
533 aa  65.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  22.89 
 
 
498 aa  65.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  22.59 
 
 
483 aa  65.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.25 
 
 
546 aa  63.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  22.47 
 
 
735 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  21.31 
 
 
803 aa  63.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  30 
 
 
474 aa  63.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.96 
 
 
507 aa  63.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  23.22 
 
 
713 aa  62.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  28.93 
 
 
478 aa  62.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  22.78 
 
 
676 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880715  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  31.93 
 
 
714 aa  61.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.76 
 
 
507 aa  60.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  21.67 
 
 
681 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  23.01 
 
 
472 aa  59.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  22.22 
 
 
724 aa  58.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.39 
 
 
503 aa  57.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.19 
 
 
632 aa  55.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  25.51 
 
 
745 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  21.01 
 
 
487 aa  54.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  27.15 
 
 
482 aa  53.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  24.56 
 
 
515 aa  52.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  21.88 
 
 
524 aa  52.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0388  phospholipase D/transphosphatidylase  22.19 
 
 
406 aa  52  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125442  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.1 
 
 
544 aa  50.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1793  phospholipase D/transphosphatidylase  21.51 
 
 
497 aa  50.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4046  phospholipase D/transphosphatidylase  21.3 
 
 
406 aa  50.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  25.81 
 
 
483 aa  49.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.14 
 
 
517 aa  49.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  20 
 
 
483 aa  49.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  21.77 
 
 
495 aa  48.9  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  19.56 
 
 
483 aa  48.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  26.19 
 
 
483 aa  47  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.89 
 
 
513 aa  47  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  28.15 
 
 
479 aa  45.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>