83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3860 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3860  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 691 aa  1444    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6428  phospholipase D/transphosphatidylase  36.8 
 
 		 693 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.57385 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6419  phospholipase D/transphosphatidylase  36.39 
 
 		 693 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0631752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1410  phospholipase D/transphosphatidylase  36.39 
 
 		 693 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  32.74 
 
 		 676 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  33.79 
 
 		 684 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  32.61 
 
 		 681 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_003296  RS03737  phospholipase protein  28.96 
 
 		 652 aa  194  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  27.78 
 
 		 655 aa  189  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080409 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4175  phospholipase D/transphosphatidylase  28.2 
 
 		 668 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  26.49 
 
 		 684 aa  180  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  28.14 
 
 		 745 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  45.31 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  30.43 
 
 		 525 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  28.8 
 
 		 735 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  36.17 
 
 		 730 aa  54.7  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  26.26 
 
 		 510 aa  53.9  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  27.75 
 
 		 803 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.29 
 
 		 465 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  45.45 
 
 		 512 aa  52.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  47.62 
 
 		 517 aa  52  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  24.46 
 
 		 754 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  24.46 
 
 		 734 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  24.46 
 
 		 754 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.86 
 
 		 521 aa  50.8  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06712  Phospholipase D [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F2]  23.79 
 
 		 833 aa  50.8  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  60.53 
 
 		 714 aa  50.8  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  44.26 
 
 		 518 aa  50.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  61.11 
 
 		 728 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01480  phospholipase D, putative  32.21 
 
 		 775 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  65.71 
 
 		 504 aa  50.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  29.63 
 
 		 478 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  52.63 
 
 		 502 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  34.75 
 
 		 724 aa  49.7  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  53.85 
 
 		 474 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  61.11 
 
 		 728 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.3 
 
 		 507 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  60.53 
 
 		 735 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  50 
 
 		 502 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  40 
 
 		 507 aa  48.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  50 
 
 		 504 aa  48.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  40.38 
 
 		 533 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  55.26 
 
 		 498 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1387  cardiolipin synthetase 2  28.42 
 
 		 477 aa  47  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  24.87 
 
 		 739 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  34.95 
 
 		 732 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0392  phospholipase D/transphosphatidylase  34.34 
 
 		 780 aa  47  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  26.04 
 
 		 739 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  27.69 
 
 		 572 aa  47  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  34.95 
 
 		 732 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  47.37 
 
 		 504 aa  47.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.89 
 
 		 632 aa  46.6  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  51.35 
 
 		 382 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  50 
 
 		 491 aa  46.2  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4229  phospholipase D/transphosphatidylase  46.81 
 
 		 417 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  50 
 
 		 482 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  57.14 
 
 		 713 aa  45.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  38.89 
 
 		 732 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  42.5 
 
 		 533 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  25.37 
 
 		 498 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  52.5 
 
 		 714 aa  45.8  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  61.11 
 
 		 818 aa  45.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0398  phospholipase D/transphosphatidylase  61.11 
 
 		 270 aa  45.8  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.63 
 
 		 701 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  32.35 
 
 		 516 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  37.86 
 
 		 746 aa  45.8  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  32.35 
 
 		 516 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  32.35 
 
 		 510 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12431  predicted protein  31.53 
 
 		 801 aa  45.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  40.74 
 
 		 477 aa  45.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  43.14 
 
 		 419 aa  45.4  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  25.37 
 
 		 483 aa  45.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5195  cardiolipin synthetase domain-containing protein  25.93 
 
 		 397 aa  45.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5046  cardiolipin synthetase domain-containing protein  25.93 
 
 		 397 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.560279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5439  cardiolipin synthetase domain protein  25.93 
 
 		 397 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.443747 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5591  cardiolipin synthetase domain-containing protein  25.93 
 
 		 397 aa  45.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  38 
 
 		 483 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0093  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32 
 
 		 463 aa  44.3  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325157 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5030  cardiolipin synthetase domain-containing protein  25.93 
 
 		 397 aa  44.3  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1768  phospholipase D/transphosphatidylase  29.87 
 
 		 592 aa  44.3  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346269  normal  0.0112079 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  50 
 
 		 512 aa  43.9  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  31.65 
 
 		 413 aa  43.9  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  41.3 
 
 		 478 aa  43.9  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>