70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1410 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6419  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 693 aa  1442    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0631752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1410  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 693 aa  1442    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6428  phospholipase D/transphosphatidylase  86.87 
 
 		 693 aa  1276    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.57385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3860  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.11 
 
 		 691 aa  389  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  34.01 
 
 		 684 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  32.18 
 
 		 676 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  32.63 
 
 		 681 aa  317  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_003296  RS03737  phospholipase protein  27.05 
 
 		 652 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  27.31 
 
 		 655 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080409 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4175  phospholipase D/transphosphatidylase  26.87 
 
 		 668 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  28.16 
 
 		 745 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  23.99 
 
 		 684 aa  140  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.63 
 
 		 502 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  29.7 
 
 		 735 aa  67  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  30.72 
 
 		 525 aa  65.1  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  30.67 
 
 		 491 aa  63.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  29.38 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  48.28 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  27.93 
 
 		 803 aa  60.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  29.52 
 
 		 739 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  31.64 
 
 		 714 aa  59.7  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  29.52 
 
 		 739 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  30.43 
 
 		 714 aa  58.9  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  29.48 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.38 
 
 		 498 aa  57.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  45.61 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.75 
 
 		 504 aa  55.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.12 
 
 		 701 aa  55.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  36.89 
 
 		 478 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.38 
 
 		 521 aa  55.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  30.12 
 
 		 714 aa  54.7  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  23.5 
 
 		 730 aa  53.5  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  25.61 
 
 		 504 aa  53.5  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  26.22 
 
 		 498 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  25.52 
 
 		 724 aa  53.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  26.22 
 
 		 483 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 746 aa  52  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.27 
 
 		 465 aa  50.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  32.88 
 
 		 517 aa  50.8  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  40.48 
 
 		 818 aa  50.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  38.16 
 
 		 572 aa  50.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  27.22 
 
 		 732 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  59.46 
 
 		 507 aa  48.9  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  27.22 
 
 		 732 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  37.31 
 
 		 518 aa  49.3  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.99 
 
 		 474 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  61.76 
 
 		 507 aa  47.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  31.52 
 
 		 735 aa  47.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  36 
 
 		 490 aa  47.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  51.43 
 
 		 728 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  51.43 
 
 		 728 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  25.56 
 
 		 732 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0398  phospholipase D/transphosphatidylase  35.51 
 
 		 270 aa  46.2  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  28.4 
 
 		 504 aa  46.6  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  21.57 
 
 		 1821 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5195  cardiolipin synthetase domain-containing protein  24.44 
 
 		 397 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5046  cardiolipin synthetase domain-containing protein  24.44 
 
 		 397 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.560279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5591  cardiolipin synthetase domain-containing protein  24.44 
 
 		 397 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  27.94 
 
 		 717 aa  45.8  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  26.83 
 
 		 414 aa  45.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5439  cardiolipin synthetase domain protein  24.44 
 
 		 397 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.443747 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.58 
 
 		 514 aa  45.8  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  34.72 
 
 		 382 aa  45.8  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  23.31 
 
 		 483 aa  45.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  38 
 
 		 505 aa  45.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  38 
 
 		 505 aa  45.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  47.37 
 
 		 482 aa  44.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 		 532 aa  44.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.36 
 
 		 713 aa  44.7  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  25.61 
 
 		 512 aa  44.3  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>