70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6428 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6428  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 693 aa  1444    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.57385 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6419  phospholipase D/transphosphatidylase  86.87 
 
 		 693 aa  1276    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0631752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1410  phospholipase D/transphosphatidylase  86.87 
 
 		 693 aa  1276    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3860  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.66 
 
 		 691 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  34.23 
 
 		 684 aa  347  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  34.4 
 
 		 676 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  36.99 
 
 		 681 aa  271  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4175  phospholipase D/transphosphatidylase  27.64 
 
 		 668 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  28.1 
 
 		 655 aa  190  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080409 
 
 
-
 
NC_003296  RS03737  phospholipase protein  27.04 
 
 		 652 aa  183  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  27.32 
 
 		 745 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  25.21 
 
 		 684 aa  163  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  30.3 
 
 		 735 aa  67  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  50 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  30 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  28.25 
 
 		 739 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  28.25 
 
 		 739 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  30.12 
 
 		 525 aa  60.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  29.81 
 
 		 491 aa  60.1  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  28.75 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  41.77 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  29.52 
 
 		 714 aa  55.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  28.24 
 
 		 510 aa  55.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  28.49 
 
 		 714 aa  54.7  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  24.1 
 
 		 730 aa  54.7  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  22.62 
 
 		 724 aa  51.6  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.01 
 
 		 521 aa  52  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  37.78 
 
 		 818 aa  52  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  26.19 
 
 		 478 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  28.28 
 
 		 504 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.5 
 
 		 498 aa  50.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  26.11 
 
 		 803 aa  50.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  23.6 
 
 		 701 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  31.51 
 
 		 517 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  24.12 
 
 		 504 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  41.94 
 
 		 728 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  53.19 
 
 		 507 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  23.49 
 
 		 746 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  36.84 
 
 		 572 aa  49.7  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.45 
 
 		 465 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.89 
 
 		 474 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  25.9 
 
 		 732 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  25.9 
 
 		 732 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  54.55 
 
 		 507 aa  49.3  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.48 
 
 		 504 aa  48.9  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 		 714 aa  48.9  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  54.29 
 
 		 518 aa  48.1  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.98 
 
 		 514 aa  47.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  40.32 
 
 		 728 aa  47.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  24.57 
 
 		 732 aa  47.4  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1768  phospholipase D/transphosphatidylase  31.43 
 
 		 592 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346269  normal  0.0112079 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  33.64 
 
 		 524 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  40.28 
 
 		 735 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  34.62 
 
 		 490 aa  46.2  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  24.54 
 
 		 498 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  24.54 
 
 		 483 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  37.74 
 
 		 483 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  40 
 
 		 505 aa  45.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  40 
 
 		 505 aa  45.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1300  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 		 411 aa  45.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  28.7 
 
 		 510 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  28.97 
 
 		 516 aa  45.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  28.97 
 
 		 516 aa  45.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  29.63 
 
 		 461 aa  45.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.31107  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0398  phospholipase D/transphosphatidylase  37.18 
 
 		 270 aa  44.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  42.31 
 
 		 482 aa  44.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  35.29 
 
 		 532 aa  44.3  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  40 
 
 		 533 aa  44.3  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.85 
 
 		 713 aa  44.3  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0868  phospholipase D/transphosphatidylase  25.61 
 
 		 414 aa  43.9  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>