86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1327 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  52.71 
 
 		 684 aa  680    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 676 aa  1414    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  76.1 
 
 		 681 aa  1070    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6419  phospholipase D/transphosphatidylase  33.78 
 
 		 693 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0631752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1410  phospholipase D/transphosphatidylase  33.78 
 
 		 693 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6428  phospholipase D/transphosphatidylase  34.4 
 
 		 693 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.57385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3860  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.47 
 
 		 691 aa  302  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03737  phospholipase protein  29.17 
 
 		 652 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  25.11 
 
 		 684 aa  161  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  29.25 
 
 		 655 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  27.42 
 
 		 745 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4175  phospholipase D/transphosphatidylase  24.85 
 
 		 668 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  25.78 
 
 		 714 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.39 
 
 		 507 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.64 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  27.18 
 
 		 754 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  27.18 
 
 		 754 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.09 
 
 		 507 aa  65.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  27.18 
 
 		 734 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  25.6 
 
 		 533 aa  65.1  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  22.56 
 
 		 818 aa  63.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  23.18 
 
 		 491 aa  62.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  22.53 
 
 		 1821 aa  61.6  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  22.78 
 
 		 1522 aa  61.2  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  23.95 
 
 		 533 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  22.66 
 
 		 517 aa  58.9  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  21.51 
 
 		 730 aa  57.8  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.19 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0392  phospholipase D/transphosphatidylase  24.84 
 
 		 780 aa  55.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  27.93 
 
 		 735 aa  56.2  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  22.28 
 
 		 470 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  45.45 
 
 		 512 aa  54.7  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  20.33 
 
 		 1783 aa  53.9  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  21.25 
 
 		 701 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  57.89 
 
 		 525 aa  53.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.12 
 
 		 504 aa  53.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  23 
 
 		 724 aa  52  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  23.91 
 
 		 746 aa  52  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  27.37 
 
 		 512 aa  51.2  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  22.28 
 
 		 483 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  22.01 
 
 		 498 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.21 
 
 		 474 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.65 
 
 		 465 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  44.26 
 
 		 504 aa  50.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  23.75 
 
 		 510 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  50 
 
 		 521 aa  49.7  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18970  phospholipase D  26.28 
 
 		 1103 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000786782  normal  0.317995 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.4 
 
 		 498 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  50 
 
 		 735 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  46.34 
 
 		 728 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  23.75 
 
 		 516 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  23.75 
 
 		 516 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  43.1 
 
 		 728 aa  49.3  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.81 
 
 		 632 aa  48.5  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  23.85 
 
 		 732 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  51.43 
 
 		 518 aa  48.5  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  23.85 
 
 		 732 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  34.48 
 
 		 478 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  23.85 
 
 		 732 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.45 
 
 		 486 aa  48.1  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  43.14 
 
 		 510 aa  47.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  47.22 
 
 		 504 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  48.78 
 
 		 714 aa  47.8  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0398  phospholipase D/transphosphatidylase  40 
 
 		 270 aa  47.4  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  45.45 
 
 		 396 aa  47.4  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  42 
 
 		 713 aa  47  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  36.62 
 
 		 714 aa  47  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  54.05 
 
 		 572 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.1 
 
 		 502 aa  47.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  23.62 
 
 		 739 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  45.71 
 
 		 502 aa  47  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12431  predicted protein  60 
 
 		 801 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  31.43 
 
 		 524 aa  46.6  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  47.22 
 
 		 482 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  33.96 
 
 		 483 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  38.78 
 
 		 478 aa  45.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.78 
 
 		 541 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  37.5 
 
 		 490 aa  45.4  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  52.78 
 
 		 514 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02586  conserved hypothetical protein  21.09 
 
 		 759 aa  45.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.500425  normal  0.391279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  34.55 
 
 		 803 aa  44.3  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  40 
 
 		 396 aa  44.3  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  37.5 
 
 		 419 aa  43.9  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  44 
 
 		 470 aa  43.9  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  41.18 
 
 		 505 aa  43.9  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  41.18 
 
 		 505 aa  43.9  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>