138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4970 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 684 aa  1436    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03737  phospholipase protein  48.78 
 
 		 652 aa  619  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  46.35 
 
 		 655 aa  548  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080409 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4175  phospholipase D/transphosphatidylase  44.44 
 
 		 668 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  33.33 
 
 		 745 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  25.96 
 
 		 684 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3860  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.39 
 
 		 691 aa  181  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6428  phospholipase D/transphosphatidylase  25.21 
 
 		 693 aa  163  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.57385 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  25.11 
 
 		 676 aa  161  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  25.11 
 
 		 681 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1410  phospholipase D/transphosphatidylase  23.99 
 
 		 693 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6419  phospholipase D/transphosphatidylase  23.99 
 
 		 693 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0631752 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.11 
 
 		 465 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  26.2 
 
 		 803 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  24.67 
 
 		 818 aa  72.8  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  35.92 
 
 		 470 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  41.76 
 
 		 512 aa  65.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  26.94 
 
 		 504 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  26.36 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  24.18 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  24.18 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  24.18 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  41.25 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  25.81 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  56.25 
 
 		 714 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.29 
 
 		 507 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  47.06 
 
 		 491 aa  55.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.28 
 
 		 474 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  50 
 
 		 728 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  27.68 
 
 		 512 aa  55.1  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.36 
 
 		 483 aa  55.1  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  45.1 
 
 		 484 aa  54.7  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  50 
 
 		 728 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  26.23 
 
 		 483 aa  53.9  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  25.82 
 
 		 498 aa  53.9  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  25.12 
 
 		 714 aa  53.5  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.14 
 
 		 521 aa  53.5  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.27 
 
 		 478 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.39 
 
 		 507 aa  53.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  39.51 
 
 		 735 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06712  Phospholipase D [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F2]  21.86 
 
 		 833 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  25.86 
 
 		 714 aa  52.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  55.26 
 
 		 518 aa  52.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.5 
 
 		 504 aa  51.6  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.42 
 
 		 498 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  39.71 
 
 		 730 aa  52  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  24.68 
 
 		 481 aa  51.2  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1768  phospholipase D/transphosphatidylase  37.84 
 
 		 592 aa  50.8  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346269  normal  0.0112079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  35.44 
 
 		 502 aa  50.8  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  44.26 
 
 		 478 aa  50.8  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  55.26 
 
 		 504 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.06 
 
 		 713 aa  50.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  50 
 
 		 502 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18970  phospholipase D  46.27 
 
 		 1103 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000786782  normal  0.317995 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.37 
 
 		 503 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  38.3 
 
 		 490 aa  49.3  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0398  phospholipase D/transphosphatidylase  46.67 
 
 		 270 aa  49.3  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  46.77 
 
 		 732 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  27.59 
 
 		 734 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  25 
 
 		 514 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  30.11 
 
 		 481 aa  48.9  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  46.77 
 
 		 732 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  27.59 
 
 		 754 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  27.59 
 
 		 754 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 472 aa  49.3  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  46.77 
 
 		 732 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  40 
 
 		 485 aa  48.5  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  25.74 
 
 		 482 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  28.08 
 
 		 572 aa  48.5  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  55.26 
 
 		 735 aa  48.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  42.86 
 
 		 477 aa  48.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  28.57 
 
 		 413 aa  48.1  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  29.89 
 
 		 524 aa  48.1  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  42.22 
 
 		 478 aa  48.1  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  38.1 
 
 		 486 aa  48.1  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  51.28 
 
 		 533 aa  47.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  30.67 
 
 		 401 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  53.85 
 
 		 632 aa  47.4  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  40.3 
 
 		 474 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  40.82 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0392  phospholipase D/transphosphatidylase  53.66 
 
 		 780 aa  47  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.73 
 
 		 489 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.67 
 
 		 701 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  52.63 
 
 		 724 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  36.36 
 
 		 382 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5195  cardiolipin synthetase domain-containing protein  26.47 
 
 		 397 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5030  cardiolipin synthetase domain-containing protein  26.47 
 
 		 397 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5046  cardiolipin synthetase domain-containing protein  26.47 
 
 		 397 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.560279  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0444  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 		 442 aa  46.2  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5591  cardiolipin synthetase domain-containing protein  26.47 
 
 		 397 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5439  cardiolipin synthetase domain protein  26.47 
 
 		 397 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.443747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  28.28 
 
 		 476 aa  46.6  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  34.34 
 
 		 1783 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  26.44 
 
 		 505 aa  46.6  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  26.44 
 
 		 505 aa  46.6  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1918  cardiolipin synthetase domain protein  24.04 
 
 		 403 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.3 
 
 		 477 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02586  conserved hypothetical protein  38.36 
 
 		 759 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.500425  normal  0.391279 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  26.85 
 
 		 488 aa  45.8  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12431  predicted protein  74.07 
 
 		 801 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>