96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2196 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 632 aa  1240    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  46.05 
 
 		 533 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  45.28 
 
 		 533 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  46.97 
 
 		 510 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  46.27 
 
 		 516 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  46.27 
 
 		 516 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  48.55 
 
 		 734 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  48.55 
 
 		 754 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  48.55 
 
 		 754 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  50.71 
 
 		 382 aa  249  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  54.11 
 
 		 546 aa  249  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  29.96 
 
 		 470 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  28.14 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  26.28 
 
 		 512 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.47 
 
 		 521 aa  106  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.2 
 
 		 544 aa  100  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  26.12 
 
 		 714 aa  95.1  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  26.86 
 
 		 483 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  26.57 
 
 		 498 aa  91.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  27.04 
 
 		 714 aa  89.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.69 
 
 		 498 aa  87.8  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  26.05 
 
 		 502 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  23.36 
 
 		 720 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  26.15 
 
 		 525 aa  87  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  28.4 
 
 		 515 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.4 
 
 		 474 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.85 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.85 
 
 		 502 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.95 
 
 		 514 aa  80.5  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.4 
 
 		 701 aa  80.5  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  24.2 
 
 		 730 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  26.62 
 
 		 1821 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  28.69 
 
 		 504 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2067  phospholipase D/Transphosphatidylase  24 
 
 		 536 aa  78.2  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.800822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  28.53 
 
 		 504 aa  77.8  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  26.06 
 
 		 714 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  30.2 
 
 		 512 aa  76.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.79 
 
 		 713 aa  77  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  26.53 
 
 		 735 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  26.89 
 
 		 739 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.97 
 
 		 517 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  25.98 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  24.77 
 
 		 510 aa  73.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  30.41 
 
 		 491 aa  72  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.74 
 
 		 504 aa  72  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  23.29 
 
 		 1783 aa  71.6  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  25.97 
 
 		 803 aa  71.2  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  26.89 
 
 		 739 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  24.83 
 
 		 572 aa  70.9  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.92 
 
 		 507 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  34.64 
 
 		 472 aa  70.1  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  37.88 
 
 		 724 aa  70.1  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  28.21 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.78 
 
 		 507 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.85 
 
 		 513 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  33.93 
 
 		 482 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0392  phospholipase D/transphosphatidylase  23.71 
 
 		 780 aa  64.3  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1768  phospholipase D/transphosphatidylase  38.1 
 
 		 592 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346269  normal  0.0112079 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  24.62 
 
 		 1522 aa  62.8  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  21.83 
 
 		 738 aa  59.7  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  33.5 
 
 		 746 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.78 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  24.49 
 
 		 518 aa  58.9  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  32.55 
 
 		 732 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  30.63 
 
 		 524 aa  57  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  32.08 
 
 		 732 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  32.08 
 
 		 732 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  37.21 
 
 		 818 aa  54.7  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12431  predicted protein  26.86 
 
 		 801 aa  53.9  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  33.17 
 
 		 728 aa  53.9  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  32.82 
 
 		 728 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  28.64 
 
 		 717 aa  51.2  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06712  Phospholipase D [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F2]  46.43 
 
 		 833 aa  51.2  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  43.08 
 
 		 684 aa  50.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3563  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.27 
 
 		 497 aa  48.9  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01480  phospholipase D, putative  37.04 
 
 		 775 aa  48.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  53.85 
 
 		 684 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  24.45 
 
 		 676 aa  47.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880715  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07334  phospholipase D (PLD), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16520)  41.46 
 
 		 1219 aa  47.4  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02586  conserved hypothetical protein  40.91 
 
 		 759 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.500425  normal  0.391279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3860  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.89 
 
 		 691 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  38.71 
 
 		 655 aa  45.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080409 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  28.3 
 
 		 479 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  21.89 
 
 		 494 aa  44.3  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  28.3 
 
 		 479 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  28.3 
 
 		 479 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  28.3 
 
 		 479 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  28.3 
 
 		 479 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  21.89 
 
 		 494 aa  44.3  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  23.47 
 
 		 483 aa  44.3  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  28.3 
 
 		 479 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  24.17 
 
 		 479 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  28.3 
 
 		 479 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  39.19 
 
 		 386 aa  43.9  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  32.86 
 
 		 401 aa  43.9  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  25.81 
 
 		 735 aa  43.9  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>