191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4320 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  100 
 
 		 512 aa  1071    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  30.37 
 
 		 533 aa  150  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  28.72 
 
 		 533 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  28.84 
 
 		 516 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  28.84 
 
 		 516 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  29.05 
 
 		 510 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.23 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.87 
 
 		 546 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  27.42 
 
 		 470 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.42 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  30.28 
 
 		 734 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  30.28 
 
 		 754 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  30.28 
 
 		 754 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  27.25 
 
 		 739 aa  95.1  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  27.25 
 
 		 739 aa  94.7  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  26.86 
 
 		 478 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  27.71 
 
 		 504 aa  92  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  25.84 
 
 		 732 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  25.51 
 
 		 724 aa  90.5  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  24.73 
 
 		 518 aa  90.1  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  27.06 
 
 		 502 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.61 
 
 		 498 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  26.86 
 
 		 735 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  24.29 
 
 		 701 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  25.56 
 
 		 732 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  25.56 
 
 		 732 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  26.92 
 
 		 525 aa  89  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.06 
 
 		 504 aa  86.7  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  26.17 
 
 		 714 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  27.25 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  26.75 
 
 		 746 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  27.81 
 
 		 735 aa  84.7  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  25.91 
 
 		 714 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.84 
 
 		 502 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  25.83 
 
 		 803 aa  82  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.35 
 
 		 521 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.37 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.47 
 
 		 632 aa  80.1  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  24.54 
 
 		 510 aa  80.1  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  28.35 
 
 		 572 aa  80.1  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.33 
 
 		 514 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  25.49 
 
 		 517 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  24.75 
 
 		 1522 aa  78.2  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  23.59 
 
 		 1821 aa  77.8  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  24.83 
 
 		 720 aa  77  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  26.71 
 
 		 1783 aa  76.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  26.35 
 
 		 504 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  24.05 
 
 		 730 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.04 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  27.66 
 
 		 714 aa  73.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.7 
 
 		 713 aa  73.6  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.11 
 
 		 544 aa  72.8  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  28.38 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  28.13 
 
 		 728 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  25.82 
 
 		 512 aa  70.5  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  28.13 
 
 		 728 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.3 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.1 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  44.87 
 
 		 655 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080409 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  26.15 
 
 		 472 aa  66.6  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  41.76 
 
 		 684 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  23.17 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  23.17 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  24.37 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1768  phospholipase D/transphosphatidylase  24.39 
 
 		 592 aa  63.9  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346269  normal  0.0112079 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  23.96 
 
 		 498 aa  63.9  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12431  predicted protein  26.6 
 
 		 801 aa  63.9  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  45.07 
 
 		 818 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  49.12 
 
 		 745 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  23.05 
 
 		 717 aa  60.5  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.37 
 
 		 491 aa  59.7  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07550  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  23.33 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  23.79 
 
 		 483 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.5 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02586  conserved hypothetical protein  25.81 
 
 		 759 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.500425  normal  0.391279 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6428  phospholipase D/transphosphatidylase  41.77 
 
 		 693 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.57385 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  23.3 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4175  phospholipase D/transphosphatidylase  50 
 
 		 668 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1410  phospholipase D/transphosphatidylase  45.61 
 
 		 693 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6419  phospholipase D/transphosphatidylase  45.61 
 
 		 693 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0631752 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  23.29 
 
 		 524 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06712  Phospholipase D [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F2]  41.86 
 
 		 833 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  64.86 
 
 		 681 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  26.15 
 
 		 515 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.94 
 
 		 513 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1743  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.73 
 
 		 432 aa  55.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0415723  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  49.12 
 
 		 684 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0398  phospholipase D/transphosphatidylase  55.81 
 
 		 270 aa  54.7  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  45.45 
 
 		 676 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  23.6 
 
 		 396 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03737  phospholipase protein  47.62 
 
 		 652 aa  54.3  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4057  cardiolipin synthetase  22.22 
 
 		 518 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  23.79 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  22.59 
 
 		 483 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18970  phospholipase D  41.1 
 
 		 1103 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000786782  normal  0.317995 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  22.44 
 
 		 481 aa  52  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.1 
 
 		 476 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  24.84 
 
 		 482 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  22.1 
 
 		 476 aa  52  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3860  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.45 
 
 		 691 aa  52  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>