67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2998 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  50.5 
 
 
684 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
681 aa  1420    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  76.1 
 
 
676 aa  1070    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880715  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1410  phospholipase D/transphosphatidylase  33.42 
 
 
693 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6419  phospholipase D/transphosphatidylase  33.42 
 
 
693 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0631752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3860  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.2 
 
 
691 aa  298  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6428  phospholipase D/transphosphatidylase  36.99 
 
 
693 aa  271  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.57385 
 
 
-
 
NC_003296  RS03737  phospholipase protein  26.43 
 
 
652 aa  172  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361458  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  25.11 
 
 
684 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  27.84 
 
 
745 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4175  phospholipase D/transphosphatidylase  24.89 
 
 
668 aa  145  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  28.1 
 
 
655 aa  118  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080409 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  22.95 
 
 
730 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  23.77 
 
 
714 aa  72.8  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.79 
 
 
474 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  25.55 
 
 
818 aa  67  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  22.86 
 
 
478 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.75 
 
 
507 aa  65.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  22.38 
 
 
701 aa  65.1  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.7 
 
 
507 aa  64.3  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 
510 aa  62.4  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  23.74 
 
 
1821 aa  62.4  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  25.36 
 
 
724 aa  61.6  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  23.37 
 
 
504 aa  61.6  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  22.78 
 
 
491 aa  61.2  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  23.91 
 
 
572 aa  60.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  21.67 
 
 
1522 aa  60.1  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  23.34 
 
 
504 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0392  phospholipase D/transphosphatidylase  24.14 
 
 
780 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  25.98 
 
 
734 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  25.98 
 
 
754 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  25.98 
 
 
754 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  22.48 
 
 
517 aa  58.9  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  21.87 
 
 
714 aa  58.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18970  phospholipase D  35.05 
 
 
1103 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000786782  normal  0.317995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  23.39 
 
 
803 aa  57.4  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  64.86 
 
 
512 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  25.24 
 
 
533 aa  55.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.01 
 
 
498 aa  55.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  23.81 
 
 
1783 aa  54.7  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  22.62 
 
 
512 aa  54.7  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  29.78 
 
 
735 aa  54.3  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  23.91 
 
 
382 aa  54.3  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.47 
 
 
465 aa  53.9  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  28.96 
 
 
735 aa  53.9  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.37 
 
 
546 aa  51.6  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0398  phospholipase D/transphosphatidylase  43.33 
 
 
270 aa  51.2  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  58.82 
 
 
518 aa  50.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  55.56 
 
 
525 aa  50.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  43.14 
 
 
470 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  26.16 
 
 
524 aa  49.3  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  46 
 
 
713 aa  48.9  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.38 
 
 
503 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  25 
 
 
533 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.44 
 
 
521 aa  47.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  51.43 
 
 
728 aa  47.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  51.43 
 
 
728 aa  47.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  45.71 
 
 
502 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.57 
 
 
502 aa  47  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12431  predicted protein  62.86 
 
 
801 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  46.34 
 
 
714 aa  46.2  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  21.43 
 
 
510 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.24 
 
 
504 aa  45.8  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  52.78 
 
 
514 aa  44.3  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  46.34 
 
 
738 aa  44.3  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  44.44 
 
 
482 aa  43.9  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  19.67 
 
 
483 aa  43.9  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>