81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2067 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2067  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 
536 aa  1107    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.800822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  24.58 
 
 
510 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.36 
 
 
546 aa  87.8  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  24.16 
 
 
516 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  24.16 
 
 
516 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  26.96 
 
 
533 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  23.3 
 
 
720 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  23.59 
 
 
518 aa  78.2  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  25.34 
 
 
498 aa  77  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  25.07 
 
 
483 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  23.54 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.19 
 
 
498 aa  73.6  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  26.72 
 
 
512 aa  72.8  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  25.5 
 
 
533 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.63 
 
 
504 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  26.5 
 
 
714 aa  71.6  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  22.17 
 
 
502 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  24.93 
 
 
491 aa  70.5  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  24.93 
 
 
730 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  24.58 
 
 
735 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  29.21 
 
 
714 aa  70.1  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  31.79 
 
 
746 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.16 
 
 
701 aa  68.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  24.06 
 
 
724 aa  67.4  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  24.44 
 
 
504 aa  65.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.7 
 
 
507 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  28.17 
 
 
732 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.07 
 
 
521 aa  65.1  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  28.17 
 
 
732 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  28.17 
 
 
732 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  24.42 
 
 
525 aa  64.7  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  26.43 
 
 
482 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  24.78 
 
 
739 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  24.78 
 
 
739 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  29.12 
 
 
735 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.55 
 
 
514 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.34 
 
 
502 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  24.24 
 
 
754 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  24.57 
 
 
512 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  24.24 
 
 
734 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  24.24 
 
 
754 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.77 
 
 
382 aa  62  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.07 
 
 
503 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.76 
 
 
544 aa  61.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  26.02 
 
 
484 aa  60.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.11 
 
 
507 aa  60.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.66 
 
 
508 aa  60.8  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  32 
 
 
515 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.88 
 
 
465 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  32 
 
 
513 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  25.22 
 
 
470 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  30.92 
 
 
728 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  23.65 
 
 
483 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  21.69 
 
 
738 aa  56.6  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  31.58 
 
 
728 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  25.78 
 
 
510 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  24.32 
 
 
717 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  24.08 
 
 
714 aa  55.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.41 
 
 
632 aa  55.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.03 
 
 
474 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  23.24 
 
 
504 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  22.25 
 
 
803 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  21.24 
 
 
517 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  21.9 
 
 
488 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.29 
 
 
713 aa  50.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  31.16 
 
 
494 aa  50.4  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  31.16 
 
 
494 aa  50.4  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  22.02 
 
 
572 aa  50.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.16 
 
 
517 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  26.32 
 
 
472 aa  49.7  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  20.45 
 
 
470 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.3 
 
 
481 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3563  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.97 
 
 
497 aa  45.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  21.53 
 
 
490 aa  45.1  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  31.43 
 
 
439 aa  44.7  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.55 
 
 
486 aa  44.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  24.66 
 
 
1821 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  25.4 
 
 
396 aa  43.9  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  25.17 
 
 
505 aa  43.5  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  25.17 
 
 
505 aa  43.5  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  24.24 
 
 
486 aa  43.5  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>