32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2631 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2631  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  487  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  23.9 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3984  SNARE associated Golgi protein  20.99 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000349045  normal  0.413743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  22.84 
 
 
232 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  24.12 
 
 
738 aa  50.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0621  hypothetical protein  23.75 
 
 
220 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  23.46 
 
 
232 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  23.98 
 
 
232 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  24.05 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  25 
 
 
238 aa  46.6  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  26.72 
 
 
238 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  22.22 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5638  SNARE associated Golgi protein-like protein  21.43 
 
 
223 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  25 
 
 
735 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  22.92 
 
 
174 aa  45.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  26.88 
 
 
246 aa  45.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  24.5 
 
 
209 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  23.36 
 
 
803 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  26.76 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  23.87 
 
 
746 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  24.83 
 
 
717 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  24 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  25.95 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  25.78 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  24 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  25.83 
 
 
226 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  24 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 
717 aa  43.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  23.13 
 
 
231 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  23.7 
 
 
716 aa  42  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  18.97 
 
 
304 aa  41.6  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  26.35 
 
 
267 aa  42  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>