More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0513 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2427  ABC transporter protein  58.6 
 
 		 554 aa  657    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4146  toxin secretion ABC transporter protein  71.35 
 
 		 549 aa  810    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0513  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 552 aa  1120    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2135  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  31.68 
 
 		 581 aa  258  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0732  ABC transporter related  30.31 
 
 		 886 aa  226  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.93423  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  31.14 
 
 		 738 aa  211  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  30.9 
 
 		 767 aa  209  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  28.17 
 
 		 776 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  30.39 
 
 		 776 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  28.82 
 
 		 727 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  27.17 
 
 		 738 aa  195  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  29.5 
 
 		 721 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  27.27 
 
 		 731 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  26.93 
 
 		 734 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  28.12 
 
 		 718 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  28.12 
 
 		 718 aa  191  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  25.48 
 
 		 734 aa  189  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  31.17 
 
 		 718 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  31.17 
 
 		 718 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  28.95 
 
 		 716 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  31.17 
 
 		 718 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  26.1 
 
 		 704 aa  187  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  27.37 
 
 		 723 aa  186  9e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  29.2 
 
 		 920 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  24.31 
 
 		 704 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  30.59 
 
 		 718 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  25.15 
 
 		 737 aa  183  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  27.16 
 
 		 743 aa  182  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  26.63 
 
 		 707 aa  182  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  25.14 
 
 		 762 aa  181  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  27.17 
 
 		 756 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  28.17 
 
 		 718 aa  178  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  25.71 
 
 		 740 aa  178  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0786  ABC transporter related  27.68 
 
 		 722 aa  177  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  25.63 
 
 		 718 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  27.44 
 
 		 722 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  27.65 
 
 		 713 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  24.41 
 
 		 712 aa  171  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  29.9 
 
 		 719 aa  172  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  27.05 
 
 		 733 aa  172  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1190  ABC transporter-related protein  27.99 
 
 		 701 aa  171  3e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.61 
 
 		 694 aa  171  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  26.75 
 
 		 720 aa  171  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  26.55 
 
 		 722 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0731  ABC transporter related  26.03 
 
 		 713 aa  167  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.269341  normal  0.324121 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  27.02 
 
 		 733 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  26.87 
 
 		 719 aa  166  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  23.78 
 
 		 712 aa  166  9e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  26.81 
 
 		 731 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  24.86 
 
 		 714 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  25.84 
 
 		 867 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3810  type I secretion system ATPase  28.93 
 
 		 711 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509223 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  25.78 
 
 		 725 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  24.66 
 
 		 714 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  25.19 
 
 		 725 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  25.19 
 
 		 725 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  24.45 
 
 		 730 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  26.45 
 
 		 687 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  25.19 
 
 		 725 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  24.77 
 
 		 725 aa  163  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  24.91 
 
 		 711 aa  163  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  24.95 
 
 		 726 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  24.21 
 
 		 718 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  23.48 
 
 		 726 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  24.53 
 
 		 725 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  25.33 
 
 		 725 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0277  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.12 
 
 		 722 aa  161  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358475  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  24.53 
 
 		 725 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  22.96 
 
 		 726 aa  160  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40240  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  27.42 
 
 		 723 aa  160  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.587032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  24.24 
 
 		 723 aa  159  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  25.39 
 
 		 725 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  27.36 
 
 		 721 aa  158  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  24.24 
 
 		 726 aa  156  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  24.47 
 
 		 721 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1077  type I secretion system ATPase  28.16 
 
 		 726 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  24.4 
 
 		 871 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4207  ABC transporter related  26.59 
 
 		 706 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2196  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  26.37 
 
 		 763 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.338051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2060  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.37 
 
 		 763 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  26.39 
 
 		 741 aa  154  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  25.85 
 
 		 739 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  23.34 
 
 		 725 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4325  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.38 
 
 		 767 aa  150  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  26.36 
 
 		 740 aa  150  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  25.09 
 
 		 720 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  26.07 
 
 		 719 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  24.77 
 
 		 725 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  23.44 
 
 		 727 aa  146  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  24.49 
 
 		 739 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1599  ABC drug efflux transporter, fused ATPase and inner mebrane subunits  24.34 
 
 		 751 aa  145  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.164249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  25.81 
 
 		 718 aa  144  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  24.57 
 
 		 1013 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  25.54 
 
 		 721 aa  143  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  25.33 
 
 		 779 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  25.37 
 
 		 712 aa  143  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0584  type I secretion system ATPase family protein  25.42 
 
 		 720 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  25.14 
 
 		 712 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4513  ABC transporter related  26.49 
 
 		 562 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0442497 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3121  ABC transporter related  25 
 
 		 730 aa  141  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.184456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>