More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3332 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  100 
 
 		 416 aa  863    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  37.35 
 
 		 450 aa  281  1e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  37.92 
 
 		 475 aa  280  3e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  37.44 
 
 		 464 aa  265  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.18 
 
 		 468 aa  256  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2156  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.51 
 
 		 459 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  28.36 
 
 		 446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0472  putative capK protein  27.23 
 
 		 459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000021402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  29.29 
 
 		 458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3406  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.87 
 
 		 478 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4415  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.47 
 
 		 480 aa  156  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.992937  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  28.36 
 
 		 475 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  29.22 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.72 
 
 		 454 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  29.78 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  29.16 
 
 		 466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  27.83 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  27.27 
 
 		 453 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.08 
 
 		 453 aa  133  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  27.49 
 
 		 469 aa  133  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.34 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  24.43 
 
 		 463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  28.15 
 
 		 437 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  23.49 
 
 		 437 aa  129  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  27.9 
 
 		 445 aa  129  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  26.68 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.88 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  26.03 
 
 		 441 aa  123  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0111  capsular polysacharride biosynthesis gene, putative  27.4 
 
 		 422 aa  120  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000821148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  25.41 
 
 		 450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  27.91 
 
 		 467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0807  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.28 
 
 		 452 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.316461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  27.78 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  24.88 
 
 		 448 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  25.8 
 
 		 459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  25.68 
 
 		 453 aa  113  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  27.12 
 
 		 426 aa  104  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00696  hypothetical protein  26.24 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  23.06 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  26.67 
 
 		 479 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  28.02 
 
 		 433 aa  94  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.4 
 
 		 461 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  29.45 
 
 		 458 aa  91.3  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  25.42 
 
 		 427 aa  91.3  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  25.6 
 
 		 440 aa  90.5  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  28.19 
 
 		 462 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  24.35 
 
 		 460 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  24.64 
 
 		 450 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  29.41 
 
 		 472 aa  87.8  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  28.57 
 
 		 447 aa  87.4  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  34.36 
 
 		 452 aa  87  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.39 
 
 		 436 aa  86.7  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  27.63 
 
 		 445 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3276  coenzyme F390 synthetase-like protein  35.53 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  27.49 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  26.74 
 
 		 563 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2614  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.97 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0133  Phenylacetate--CoA ligase  24.48 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0426675  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  27.86 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  24.73 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5790  phenylacetate--CoA ligase  31.93 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  25.07 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  26.61 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  26.39 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  30.18 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.14 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.72 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  26.4 
 
 		 448 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  33.14 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  31.18 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.7 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  30.73 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1132  Phenylacetate--CoA ligase  33.87 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  23.99 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  24.71 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  24.55 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  27.52 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2409  phenylacetate-CoA ligase  24.14 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  23.54 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  23.6 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  27.27 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  23.69 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  23.74 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  26.01 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.95 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  32.14 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1676  phenylacetate--CoA ligase  29.22 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  28.78 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  23.5 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  23.51 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  22.84 
 
 		 502 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1814  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.2 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4201  coenzyme F390 synthetase-like  26.96 
 
 		 457 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  26.71 
 
 		 524 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1546  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.1 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  32.32 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1877  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.62 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1469  hypothetical protein  22.48 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>