95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3406 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3406  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 		 478 aa  920    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4415  coenzyme F390 synthetase-like protein  64.49 
 
 		 480 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.992937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  29.95 
 
 		 416 aa  172  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 468 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.99 
 
 		 450 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.97 
 
 		 475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  29.62 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  26.89 
 
 		 446 aa  99  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  20.63 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  25.9 
 
 		 475 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  20.95 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  25.89 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  25.4 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  25.66 
 
 		 446 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  29.56 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2156  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.05 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0472  putative capK protein  19.31 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000021402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  26.25 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.89 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  23.88 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_002950  PG0111  capsular polysacharride biosynthesis gene, putative  26.56 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000821148 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  24.73 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  21.75 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  25.75 
 
 		 502 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  28.21 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  25.78 
 
 		 487 aa  63.9  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  28.89 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0807  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.63 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.316461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00696  hypothetical protein  23.9 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2557  phenylacetate-CoA ligase  34.93 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  35.37 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4201  coenzyme F390 synthetase-like  26.06 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  27.74 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  31.37 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  30.11 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  31.82 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  24.85 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  30.87 
 
 		 433 aa  54.7  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  27.31 
 
 		 453 aa  54.3  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  24.83 
 
 		 469 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0838  phenylacetate--CoA ligase  39.22 
 
 		 431 aa  53.9  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  30.58 
 
 		 442 aa  53.9  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 448 aa  53.9  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.51 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  22.45 
 
 		 460 aa  51.2  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  36.05 
 
 		 423 aa  51.2  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  31.3 
 
 		 450 aa  50.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  26.97 
 
 		 443 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.32 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  29.44 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  31.32 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  29.11 
 
 		 432 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1556  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.58 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.30077  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0226  coenzyme F390 synthetase  25.93 
 
 		 454 aa  48.5  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  29.87 
 
 		 426 aa  48.5  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0382  phenylacetate--CoA ligase  42.31 
 
 		 442 aa  47.4  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  29.17 
 
 		 435 aa  47.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1925  hypothetical protein  24.7 
 
 		 426 aa  47.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.132933  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.91 
 
 		 453 aa  47  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  28.51 
 
 		 431 aa  47  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  28.42 
 
 		 431 aa  46.6  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1132  Phenylacetate--CoA ligase  28.16 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  32.35 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  29.34 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2517  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.570913  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02970  possible capK protein  23.2 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240993  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  28.46 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  24.31 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  27.68 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  27.54 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  30.22 
 
 		 436 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  28.98 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  28.82 
 
 		 437 aa  45.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1919  hypothetical protein  26.37 
 
 		 493 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  26.23 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1908  hypothetical protein  25 
 
 		 493 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  25.72 
 
 		 459 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  26.61 
 
 		 433 aa  44.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  28.57 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  47.06 
 
 		 437 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1469  hypothetical protein  22.42 
 
 		 431 aa  44.7  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  29.37 
 
 		 430 aa  44.3  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32330  coenzyme F390 synthetase  32.89 
 
 		 548 aa  44.3  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.530062 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0388  phenylacetate-CoA ligase  27.81 
 
 		 427 aa  44.3  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.128203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  25.24 
 
 		 434 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  28.99 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6182  phenylacetate-CoA ligase  26.48 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  26.32 
 
 		 450 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1546  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.26 
 
 		 443 aa  43.5  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3276  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.81 
 
 		 417 aa  43.9  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  27.75 
 
 		 435 aa  43.5  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3140  hypothetical protein  29.25 
 
 		 447 aa  43.5  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  29.95 
 
 		 435 aa  43.1  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  34.29 
 
 		 462 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3365  AMP-dependent synthetase and ligase  27.72 
 
 		 402 aa  43.1  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>