More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3567 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  100 
 
 		 502 aa  1014    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  36.99 
 
 		 445 aa  248  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  32.17 
 
 		 469 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  30.05 
 
 		 480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  31.53 
 
 		 457 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  31.88 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.09 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  30.3 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.29 
 
 		 448 aa  170  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.43 
 
 		 475 aa  169  9e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  29.29 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  29.02 
 
 		 464 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  32.36 
 
 		 437 aa  161  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.13 
 
 		 454 aa  160  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  28.87 
 
 		 453 aa  160  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  29.05 
 
 		 439 aa  159  9e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  31.66 
 
 		 461 aa  153  8.999999999999999e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  28.5 
 
 		 459 aa  150  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.28 
 
 		 450 aa  150  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  28.54 
 
 		 450 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  29.23 
 
 		 446 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  27.65 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  27.78 
 
 		 461 aa  136  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  27.34 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  23.99 
 
 		 437 aa  130  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.32 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  26.19 
 
 		 426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  27.58 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  28.43 
 
 		 448 aa  121  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  27.43 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4201  coenzyme F390 synthetase-like  27.53 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  26.43 
 
 		 475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  27.85 
 
 		 467 aa  110  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  24.78 
 
 		 487 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  22.58 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  26.13 
 
 		 446 aa  101  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02970  possible capK protein  21.52 
 
 		 435 aa  98.2  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240993  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  28.57 
 
 		 479 aa  97.8  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  22.72 
 
 		 563 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 		 468 aa  87.4  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0662  Coenzyme F390 synthetase-like protein  29.39 
 
 		 425 aa  86.7  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  23.2 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1652  coenzyme F390 synthetase-like  24.86 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.42 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  22.2 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  27.73 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  20.64 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4415  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.32 
 
 		 480 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.992937  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.08 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  23.66 
 
 		 416 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  30 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  23.08 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  30.43 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  27.19 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  23.98 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  24.78 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  26.24 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2409  phenylacetate-CoA ligase  24.22 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32330  coenzyme F390 synthetase  34.87 
 
 		 548 aa  71.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.530062 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  25.45 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.7 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  41.59 
 
 		 499 aa  70.9  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480543  normal  0.642878 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  37.61 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  26.49 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  26.49 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  23.35 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  26.49 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  26.49 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  24.26 
 
 		 442 aa  69.7  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  23.05 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.93 
 
 		 468 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  26.57 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  24.71 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  23.05 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  22.14 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  25.14 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  26.89 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3406  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.75 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2152  Phenylacetate--CoA ligase  25.85 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2897  Phenylacetate--CoA ligase  25.98 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1449  phenylacetate-CoA ligase  28.1 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  25.59 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  23.19 
 
 		 433 aa  67  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.06 
 
 		 480 aa  66.6  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  27.83 
 
 		 434 aa  66.6  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  24.92 
 
 		 423 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  25.71 
 
 		 438 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  25.94 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2189  phenylacetate-CoA ligase  26.86 
 
 		 434 aa  66.6  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0357047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1004  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.92 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  26.76 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3634  phenylacetate-CoA ligase  26.69 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  22.38 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  24.4 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  20 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  25.58 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  22.4 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  24.55 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  23.28 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  23 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>