More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0662 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0662  Coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 		 425 aa  872    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3044  hypothetical protein  60.55 
 
 		 573 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.584506  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  33.16 
 
 		 439 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  25.59 
 
 		 487 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  26.37 
 
 		 469 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  26.73 
 
 		 453 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.34 
 
 		 453 aa  103  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.53 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  23.17 
 
 		 480 aa  99.8  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.28 
 
 		 464 aa  97.4  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  25 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.49 
 
 		 475 aa  96.3  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.87 
 
 		 450 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.8 
 
 		 453 aa  96.3  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  23.74 
 
 		 458 aa  94.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.32 
 
 		 457 aa  94  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  25.41 
 
 		 448 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  25.65 
 
 		 450 aa  91.7  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  25.59 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.87 
 
 		 454 aa  87.4  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  25.52 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  29.39 
 
 		 502 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  26.61 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  26.02 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  25.54 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  24.01 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  25.07 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  25.76 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  23.18 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  26.9 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  24.84 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  25.98 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1592  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  25.68 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  25.22 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  27.02 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  23.77 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  27.41 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  22.4 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  23.94 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  23.84 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  26.07 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  25.77 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  25.77 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  22.12 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  35.66 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  25.82 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  24.21 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  23.73 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4305  CapK domain-containing protein  24.35 
 
 		 481 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2897  Phenylacetate--CoA ligase  25.15 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  27.99 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  24.21 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  26.73 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  25 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  25.38 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  24 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  22.91 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  25.87 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  25.15 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  21.14 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0382  phenylacetate--CoA ligase  25.22 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1132  Phenylacetate--CoA ligase  25.51 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  25.75 
 
 		 444 aa  69.7  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  25.65 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  23.88 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0824  phenylacetate--CoA ligase  22.98 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  24.84 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  25.72 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_811  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  23.3 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0472  putative capK protein  20.58 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000021402  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  24.53 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  26.14 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  22.95 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  23.58 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  23.26 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  25.46 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  23.35 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  24.48 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2189  phenylacetate-CoA ligase  25.16 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0357047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  22.94 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0940  AMP-binding enzyme  23.92 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  24.7 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  20.82 
 
 		 413 aa  67  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  24.83 
 
 		 432 aa  67  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.96 
 
 		 436 aa  67  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  26.41 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  22.19 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  24.17 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  21.94 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  23.34 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  25.67 
 
 		 458 aa  66.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  25.08 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  24.85 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  22.66 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  24.62 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  25.16 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  24.85 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  26.09 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  27.44 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>