More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1132 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1132  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 418 aa  853    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  44.44 
 
 		 434 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  44.44 
 
 		 436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  43.57 
 
 		 437 aa  354  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  43.46 
 
 		 433 aa  349  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  43.46 
 
 		 433 aa  349  6e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  43.46 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  43.46 
 
 		 433 aa  346  5e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  41.38 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  41.77 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  39.6 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  40.15 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  37.44 
 
 		 433 aa  315  6e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  38.27 
 
 		 432 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  39.16 
 
 		 434 aa  311  9e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  39.31 
 
 		 435 aa  309  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  38.42 
 
 		 434 aa  309  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  37.93 
 
 		 434 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  43.37 
 
 		 428 aa  308  8e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0838  phenylacetate--CoA ligase  39.9 
 
 		 431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  40.05 
 
 		 433 aa  306  3e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  37.59 
 
 		 433 aa  306  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  38.27 
 
 		 439 aa  307  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  37.68 
 
 		 432 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  39.66 
 
 		 435 aa  306  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  38.42 
 
 		 431 aa  305  7e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  38.93 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  35.22 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  36.7 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  38.67 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  38.92 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  37.93 
 
 		 434 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  35.38 
 
 		 433 aa  298  8e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  36.45 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  36.5 
 
 		 433 aa  298  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  38.63 
 
 		 432 aa  296  3e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  38.67 
 
 		 433 aa  296  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  36.54 
 
 		 432 aa  296  4e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  38.67 
 
 		 433 aa  296  6e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  34.89 
 
 		 433 aa  296  6e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  38.08 
 
 		 433 aa  295  9e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  36.3 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  35.71 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  36.61 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  35.96 
 
 		 433 aa  295  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  39.21 
 
 		 429 aa  293  3e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  34.48 
 
 		 433 aa  293  3e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  36.83 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  37.75 
 
 		 434 aa  292  7e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  36.05 
 
 		 432 aa  292  8e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  36.45 
 
 		 436 aa  290  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  35.71 
 
 		 435 aa  290  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  38.92 
 
 		 432 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  38.77 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  39.16 
 
 		 435 aa  290  3e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  35.87 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  37.44 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  38.08 
 
 		 434 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  38.24 
 
 		 435 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  37.44 
 
 		 430 aa  289  8e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  36.7 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  36.7 
 
 		 432 aa  287  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  39.16 
 
 		 434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  35.38 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  35.31 
 
 		 432 aa  286  5e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  35.8 
 
 		 434 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  38.01 
 
 		 446 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  37.22 
 
 		 429 aa  285  8e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  35.96 
 
 		 432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  37.44 
 
 		 428 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  37.31 
 
 		 428 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  36.36 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  38.21 
 
 		 423 aa  280  4e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  37.93 
 
 		 432 aa  280  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  38.54 
 
 		 438 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  36.61 
 
 		 434 aa  277  3e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  35.89 
 
 		 431 aa  276  7e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  36.12 
 
 		 433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  36.72 
 
 		 430 aa  272  7e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  36.92 
 
 		 439 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  39.26 
 
 		 443 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  34.64 
 
 		 439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  38.63 
 
 		 434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  35.61 
 
 		 439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  38.93 
 
 		 434 aa  270  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  37.04 
 
 		 437 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  36.75 
 
 		 441 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  37.22 
 
 		 436 aa  269  8e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  34.4 
 
 		 439 aa  269  8e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  38.14 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  36.82 
 
 		 445 aa  268  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1908  phenylacetate-CoA ligase  37.38 
 
 		 446 aa  268  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  33.91 
 
 		 439 aa  268  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  39.2 
 
 		 434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  36.45 
 
 		 444 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  37.47 
 
 		 444 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  38.36 
 
 		 432 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  36.97 
 
 		 436 aa  266  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  34.16 
 
 		 433 aa  266  7e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  35.96 
 
 		 441 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>