More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0382 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0382  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 442 aa  897    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  39.68 
 
 		 433 aa  347  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  42.07 
 
 		 436 aa  341  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  40.71 
 
 		 433 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  40.47 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  40.65 
 
 		 435 aa  340  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  40.53 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  39.22 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  38.19 
 
 		 433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  43.75 
 
 		 438 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  40.81 
 
 		 433 aa  319  5e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  39.86 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  38.07 
 
 		 432 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  40.24 
 
 		 437 aa  310  4e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  42 
 
 		 428 aa  308  9e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  40.34 
 
 		 432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  35.35 
 
 		 432 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  37.67 
 
 		 432 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  35.14 
 
 		 432 aa  306  7e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  35.14 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  36.19 
 
 		 433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  35.71 
 
 		 433 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  38.69 
 
 		 432 aa  302  8.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  35.71 
 
 		 433 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  39.72 
 
 		 430 aa  301  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  37.24 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  37.73 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  34.87 
 
 		 432 aa  300  3e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  37.35 
 
 		 439 aa  300  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0838  phenylacetate--CoA ligase  39.27 
 
 		 431 aa  299  6e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  37.65 
 
 		 433 aa  299  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  36.69 
 
 		 436 aa  299  9e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  35.45 
 
 		 433 aa  298  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  34.99 
 
 		 433 aa  297  3e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  37.38 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  36.9 
 
 		 434 aa  292  9e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  37.5 
 
 		 434 aa  292  9e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  36.32 
 
 		 433 aa  292  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  37.05 
 
 		 441 aa  289  8e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  37.47 
 
 		 432 aa  289  9e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  37.17 
 
 		 423 aa  288  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  35.84 
 
 		 435 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  34.38 
 
 		 439 aa  288  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  35.31 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  37.29 
 
 		 432 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  36.45 
 
 		 437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  37.62 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  35.6 
 
 		 435 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  36.85 
 
 		 433 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  36.68 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  35.49 
 
 		 433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  35.24 
 
 		 433 aa  283  6.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  35.41 
 
 		 435 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  34.77 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  34.01 
 
 		 439 aa  280  4e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  38 
 
 		 429 aa  279  5e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  36.81 
 
 		 435 aa  279  9e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  35.21 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  35.45 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  36.78 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  35.25 
 
 		 433 aa  277  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  34.59 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  38.86 
 
 		 445 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  35.25 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  33.56 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  38.12 
 
 		 446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  37.23 
 
 		 444 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  36.36 
 
 		 443 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1585  Phenylacetate--CoA ligase  34.74 
 
 		 457 aa  270  4e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0730683 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  35 
 
 		 433 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  37.23 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  34.89 
 
 		 434 aa  266  7e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  33.56 
 
 		 442 aa  266  8e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  34.87 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  35.32 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  35.92 
 
 		 437 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  33.64 
 
 		 434 aa  264  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  36.52 
 
 		 444 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  34.37 
 
 		 448 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  34.52 
 
 		 435 aa  261  1e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  33.81 
 
 		 433 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  38.26 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  38.26 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  36.28 
 
 		 423 aa  261  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  33.73 
 
 		 436 aa  260  4e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  35.48 
 
 		 439 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  37.02 
 
 		 444 aa  259  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  33.18 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  38.03 
 
 		 441 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  34.19 
 
 		 439 aa  256  8e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  34.4 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  36.43 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  33.49 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  35.19 
 
 		 427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  33.26 
 
 		 437 aa  253  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  34.05 
 
 		 436 aa  253  5.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  33.26 
 
 		 437 aa  253  6e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  33.26 
 
 		 437 aa  253  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1236  phenylacetate-CoA ligase  34.76 
 
 		 436 aa  253  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  33.81 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>