More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0013 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 427 aa  874    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  41.57 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  42.73 
 
 		 434 aa  364  2e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  43.84 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  44.6 
 
 		 438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  42.52 
 
 		 435 aa  356  5e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  43.2 
 
 		 414 aa  356  5e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  43.72 
 
 		 439 aa  354  1e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  41.74 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  42.26 
 
 		 433 aa  354  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  43.43 
 
 		 439 aa  352  8.999999999999999e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  43.75 
 
 		 433 aa  351  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  42.33 
 
 		 414 aa  350  2e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  41.94 
 
 		 434 aa  350  2e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  44.92 
 
 		 434 aa  350  3e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  40.6 
 
 		 434 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  42.09 
 
 		 433 aa  348  7e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  43.5 
 
 		 415 aa  347  2e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  40.7 
 
 		 432 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  41.3 
 
 		 439 aa  347  2e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  40.51 
 
 		 433 aa  347  3e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  42.58 
 
 		 438 aa  347  3e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  42.56 
 
 		 439 aa  347  3e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  42.56 
 
 		 434 aa  346  4e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  41.56 
 
 		 414 aa  346  4e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  40.7 
 
 		 432 aa  346  5e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  41.2 
 
 		 433 aa  345  7e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  42.49 
 
 		 432 aa  345  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  42.32 
 
 		 433 aa  344  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  40.7 
 
 		 432 aa  343  2e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  41.01 
 
 		 435 aa  343  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  41.76 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  42 
 
 		 432 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  42.18 
 
 		 427 aa  342  7e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  41.9 
 
 		 432 aa  342  7e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  41.75 
 
 		 437 aa  342  8e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  41.94 
 
 		 435 aa  342  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  41.03 
 
 		 428 aa  341  1e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  41.53 
 
 		 434 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  41.41 
 
 		 444 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  40.79 
 
 		 429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  40.42 
 
 		 446 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  41.67 
 
 		 432 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  41.67 
 
 		 432 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  41.76 
 
 		 432 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  41.34 
 
 		 428 aa  339  5.9999999999999996e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  41.49 
 
 		 431 aa  339  5.9999999999999996e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  39.81 
 
 		 433 aa  338  9e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  40.32 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  39.68 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  41.59 
 
 		 432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  40.42 
 
 		 433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  42.26 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  40.23 
 
 		 434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  40.32 
 
 		 434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  41.36 
 
 		 432 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  42 
 
 		 434 aa  336  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  40.28 
 
 		 436 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  40.6 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  41.27 
 
 		 433 aa  334  1e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  41.01 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  41.07 
 
 		 432 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  40.84 
 
 		 434 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  41.31 
 
 		 448 aa  333  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  40.6 
 
 		 442 aa  333  5e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  42.82 
 
 		 415 aa  333  5e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  39.86 
 
 		 433 aa  332  6e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  41.08 
 
 		 444 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  43.24 
 
 		 435 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  41.41 
 
 		 434 aa  332  8e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  40.8 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  40.24 
 
 		 444 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1585  Phenylacetate--CoA ligase  40.38 
 
 		 457 aa  331  2e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0730683 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  40.56 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  39.27 
 
 		 432 aa  331  2e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  41.23 
 
 		 432 aa  330  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  41.51 
 
 		 423 aa  329  6e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  42.06 
 
 		 435 aa  329  7e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  40.98 
 
 		 434 aa  328  9e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  38.6 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  40.74 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  40.65 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  40.8 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  40.19 
 
 		 436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  41.04 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  41.4 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  41.08 
 
 		 428 aa  327  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  41.78 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  39.07 
 
 		 433 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  39.81 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  39.12 
 
 		 433 aa  325  7e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  40.33 
 
 		 431 aa  325  9e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  39.86 
 
 		 432 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  40.56 
 
 		 430 aa  325  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  39.54 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  40.23 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  40.85 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  39.63 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  41.08 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  38.55 
 
 		 436 aa  323  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>