More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2792 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 440 aa  910    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  60.46 
 
 		 447 aa  566  1e-160  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  59.08 
 
 		 447 aa  550  1e-155  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  60.73 
 
 		 458 aa  549  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  58.03 
 
 		 445 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  58.03 
 
 		 445 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  57.18 
 
 		 433 aa  513  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  56.65 
 
 		 447 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  40.05 
 
 		 443 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  40.69 
 
 		 438 aa  300  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  38.36 
 
 		 432 aa  293  6e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  38.72 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  38.36 
 
 		 433 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  38.5 
 
 		 432 aa  285  9e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  39.28 
 
 		 435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  38.64 
 
 		 435 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  37.9 
 
 		 433 aa  282  9e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  37.44 
 
 		 433 aa  280  5e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  37.95 
 
 		 433 aa  278  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  38.58 
 
 		 433 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  36.45 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  39.95 
 
 		 444 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  37.73 
 
 		 434 aa  276  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  37.41 
 
 		 434 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  37.95 
 
 		 434 aa  276  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  38.17 
 
 		 442 aa  275  8e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  36.82 
 
 		 434 aa  273  6e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  38.18 
 
 		 433 aa  272  8.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  36.96 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  37.99 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  38.58 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  38.01 
 
 		 433 aa  270  5e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  36.07 
 
 		 433 aa  269  7e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  38.04 
 
 		 435 aa  269  8e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  38.81 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  37.13 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  37.31 
 
 		 449 aa  264  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  37.67 
 
 		 433 aa  263  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  35.89 
 
 		 430 aa  264  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  35.21 
 
 		 433 aa  263  6e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  37.44 
 
 		 433 aa  262  8e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  37.1 
 
 		 439 aa  262  8.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  37.44 
 
 		 437 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  36.82 
 
 		 434 aa  261  1e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  37.81 
 
 		 435 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  38.27 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  35.55 
 
 		 439 aa  260  3e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  34.09 
 
 		 435 aa  260  3e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  34.09 
 
 		 436 aa  260  3e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  36.67 
 
 		 432 aa  260  4e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  37.02 
 
 		 434 aa  260  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  35.78 
 
 		 439 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  34.48 
 
 		 431 aa  259  7e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  36.67 
 
 		 429 aa  258  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  35.17 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  36.14 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  36.84 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  36.06 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  35.81 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  36.67 
 
 		 432 aa  257  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  35.99 
 
 		 436 aa  256  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  35.33 
 
 		 432 aa  256  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  38.36 
 
 		 440 aa  256  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  37.16 
 
 		 435 aa  255  9e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  36.67 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  34.46 
 
 		 433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  35.7 
 
 		 433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  36.3 
 
 		 432 aa  254  3e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  36.9 
 
 		 433 aa  254  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  34.62 
 
 		 432 aa  254  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  38.36 
 
 		 440 aa  254  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  36.17 
 
 		 425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  38.36 
 
 		 440 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  37.12 
 
 		 429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  38.36 
 
 		 440 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  37.53 
 
 		 440 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2897  Phenylacetate--CoA ligase  37.18 
 
 		 428 aa  253  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  36.49 
 
 		 436 aa  252  9.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  36.7 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  36.72 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  34.4 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  36.38 
 
 		 435 aa  250  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  35.94 
 
 		 427 aa  250  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  36.38 
 
 		 433 aa  250  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  34.93 
 
 		 433 aa  250  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  37.67 
 
 		 441 aa  249  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  35.39 
 
 		 433 aa  249  7e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  37.44 
 
 		 440 aa  249  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  35.93 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  37.67 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  36.16 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  35.31 
 
 		 437 aa  247  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  34.93 
 
 		 433 aa  247  4e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  38.2 
 
 		 432 aa  246  6e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  34.55 
 
 		 433 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  37.21 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  35.24 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  36.41 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  37.08 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5019  phenylacetate--CoA ligase  35.35 
 
 		 477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>