More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_5019 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0539  phenylacetate--CoA ligase  72 
 
 		 477 aa  740    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  decreased coverage  0.00138843 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3655  phenylacetate--CoA ligase  73.5 
 
 		 481 aa  731    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5019  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 477 aa  977    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2129  phenylacetate--CoA ligase  57.3 
 
 		 472 aa  551  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  37.11 
 
 		 445 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  36.79 
 
 		 445 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  36.57 
 
 		 447 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  37.61 
 
 		 458 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  36.78 
 
 		 442 aa  247  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  33.78 
 
 		 434 aa  247  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  35.52 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  35.35 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  34.91 
 
 		 434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  34.94 
 
 		 438 aa  243  7.999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  34.91 
 
 		 433 aa  242  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  35.7 
 
 		 447 aa  239  5.999999999999999e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2152  Phenylacetate--CoA ligase  34.97 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  34.95 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  32.65 
 
 		 433 aa  233  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  36.67 
 
 		 444 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  34.08 
 
 		 433 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  34.08 
 
 		 433 aa  230  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  35.91 
 
 		 444 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  35.76 
 
 		 444 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  32.12 
 
 		 435 aa  229  7e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  32.65 
 
 		 433 aa  229  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  31.98 
 
 		 432 aa  228  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  31.08 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  32.58 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  36.24 
 
 		 434 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  35.19 
 
 		 437 aa  226  7e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  34.16 
 
 		 430 aa  226  8e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  31.84 
 
 		 435 aa  226  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  35.29 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  36.47 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  36.24 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  32.19 
 
 		 434 aa  225  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  32.65 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  35.66 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  36.56 
 
 		 434 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  32.72 
 
 		 435 aa  223  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  33.33 
 
 		 436 aa  223  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  36.36 
 
 		 446 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  34 
 
 		 447 aa  223  6e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  34.03 
 
 		 448 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  33.03 
 
 		 433 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  33.63 
 
 		 433 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  31.75 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  33.63 
 
 		 449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  35.16 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  32.28 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  32.42 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  31.83 
 
 		 433 aa  221  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  34.7 
 
 		 434 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  31.82 
 
 		 433 aa  219  7e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  30.79 
 
 		 434 aa  219  7e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  31.22 
 
 		 435 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  35.39 
 
 		 440 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  35.39 
 
 		 440 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  34.93 
 
 		 440 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  32.51 
 
 		 433 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  32.11 
 
 		 435 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  35.08 
 
 		 440 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  32.66 
 
 		 434 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  35.78 
 
 		 432 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  31.14 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  31.6 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  32.88 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  35.55 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  35.32 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  35.55 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  32.43 
 
 		 428 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  34.86 
 
 		 432 aa  217  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  30.37 
 
 		 434 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  35.16 
 
 		 440 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  31.14 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  31.98 
 
 		 433 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  33.87 
 
 		 435 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  35.15 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  33.86 
 
 		 433 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  34.66 
 
 		 432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  32.65 
 
 		 433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  31.6 
 
 		 434 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  31.83 
 
 		 432 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  32.36 
 
 		 433 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  33.11 
 
 		 437 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2875  phenylacetyl-CoA-ligase protein  34.03 
 
 		 436 aa  213  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0228707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  34.27 
 
 		 434 aa  213  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  34.52 
 
 		 432 aa  213  7.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539  phenylacetate-coenzyme A ligase  34.89 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0321632  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1905  phenylacetate-coenzyme A ligase  34.89 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511484  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  33.1 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0638  phenylacetate-CoA ligase  34.89 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0935  phenylacetate-coenzyme A ligase  34.89 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3550  phenylacetate-CoA ligase  34.89 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489447  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3577  phenylacetate-CoA ligase  34.89 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  34.72 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  31.08 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  32.95 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  34.47 
 
 		 449 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>