More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3655 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3655  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 481 aa  994    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0539  phenylacetate--CoA ligase  69.31 
 
 		 477 aa  705    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  decreased coverage  0.00138843 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5019  phenylacetate--CoA ligase  73.5 
 
 		 477 aa  731    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2129  phenylacetate--CoA ligase  57.51 
 
 		 472 aa  559  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  37.61 
 
 		 458 aa  274  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  35.43 
 
 		 434 aa  268  1e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  36.49 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  34.85 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  35.7 
 
 		 447 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  36.1 
 
 		 442 aa  253  5.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  35.37 
 
 		 445 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  34.6 
 
 		 433 aa  249  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  33.03 
 
 		 434 aa  244  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  32.41 
 
 		 431 aa  242  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  34.89 
 
 		 449 aa  242  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  33.11 
 
 		 436 aa  242  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  34.68 
 
 		 440 aa  241  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  34.6 
 
 		 436 aa  239  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2152  Phenylacetate--CoA ligase  35.06 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  32.28 
 
 		 434 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  34.77 
 
 		 444 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  32.73 
 
 		 433 aa  236  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  32.73 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  34.62 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  33.48 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  33.11 
 
 		 432 aa  233  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  32.35 
 
 		 433 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  32.73 
 
 		 434 aa  232  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  33.03 
 
 		 428 aa  232  9e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  35.68 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  34.32 
 
 		 446 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  32.27 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  35.45 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  31.39 
 
 		 433 aa  231  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  35.45 
 
 		 440 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  35.45 
 
 		 440 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  35.62 
 
 		 449 aa  230  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  33.94 
 
 		 444 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  32.8 
 
 		 433 aa  229  7e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  33.78 
 
 		 449 aa  229  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  32.27 
 
 		 435 aa  229  9e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  36.32 
 
 		 445 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  33.11 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  31.54 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  31.45 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  32.95 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  32.35 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  32.88 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  32.57 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  32.44 
 
 		 435 aa  227  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  32.58 
 
 		 433 aa  227  4e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  32.05 
 
 		 430 aa  227  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  34.68 
 
 		 429 aa  227  4e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  30.86 
 
 		 432 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  32.13 
 
 		 429 aa  226  7e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  35 
 
 		 440 aa  226  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  33.11 
 
 		 433 aa  225  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  30.86 
 
 		 435 aa  225  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  33.18 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  33.72 
 
 		 432 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  33.03 
 
 		 433 aa  225  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  33.41 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2409  phenylacetate-CoA ligase  33.94 
 
 		 426 aa  225  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  33.87 
 
 		 439 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  33.56 
 
 		 441 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  33.94 
 
 		 432 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  34.77 
 
 		 440 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  34.17 
 
 		 432 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  31.88 
 
 		 433 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  34.38 
 
 		 447 aa  223  6e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  29.32 
 
 		 433 aa  223  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  33.33 
 
 		 434 aa  223  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  34.32 
 
 		 440 aa  222  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  33.94 
 
 		 432 aa  223  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  31.99 
 
 		 433 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  33.72 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  30.98 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  33.11 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  32.96 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  33.56 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  33.56 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  33.56 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  33.64 
 
 		 435 aa  221  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  33.11 
 
 		 434 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  33.63 
 
 		 447 aa  220  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  31.66 
 
 		 434 aa  220  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  33.48 
 
 		 437 aa  220  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  35.06 
 
 		 443 aa  220  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  34.09 
 
 		 439 aa  219  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  32.95 
 
 		 444 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  32.6 
 
 		 430 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  30.54 
 
 		 434 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  32.72 
 
 		 434 aa  219  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  31.67 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  30.84 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  31.19 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  30.47 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  33.04 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  34.19 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  32.82 
 
 		 441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>