More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08400 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  100 
 
 		 447 aa  927    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  81.82 
 
 		 447 aa  766    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  59.08 
 
 		 440 aa  550  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  52.15 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  52.28 
 
 		 445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  51.82 
 
 		 458 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  49.54 
 
 		 447 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  48.28 
 
 		 433 aa  418  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  39.72 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  37.95 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  37.05 
 
 		 435 aa  274  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  39.41 
 
 		 435 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  40.18 
 
 		 442 aa  272  8.000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  38.95 
 
 		 435 aa  272  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  37.19 
 
 		 434 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  37.87 
 
 		 435 aa  270  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  37.41 
 
 		 434 aa  269  8e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  38.86 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  37.73 
 
 		 433 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  37.64 
 
 		 443 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  38.95 
 
 		 434 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  36.28 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  36.7 
 
 		 439 aa  264  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  36.82 
 
 		 434 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  37.95 
 
 		 433 aa  263  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  38.86 
 
 		 444 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  37.5 
 
 		 435 aa  262  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  34.33 
 
 		 433 aa  262  1e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  38.18 
 
 		 444 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  34.79 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  35.7 
 
 		 439 aa  260  3e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  37.13 
 
 		 433 aa  259  9e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  35.68 
 
 		 433 aa  259  9e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  35.39 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  35.68 
 
 		 433 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  37.59 
 
 		 434 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  34.69 
 
 		 432 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  36.38 
 
 		 430 aa  256  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  36.2 
 
 		 432 aa  256  5e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  37.73 
 
 		 444 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  35.47 
 
 		 439 aa  255  9e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  35.76 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  33.87 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  36.67 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  36.99 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  37.5 
 
 		 446 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  35.91 
 
 		 434 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  35.87 
 
 		 435 aa  253  4.0000000000000004e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  35.75 
 
 		 433 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  34.33 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  36.51 
 
 		 437 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  35.66 
 
 		 435 aa  250  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  37.16 
 
 		 433 aa  249  6e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  37.36 
 
 		 429 aa  248  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  35.63 
 
 		 434 aa  249  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  37.36 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  37.01 
 
 		 440 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  36.22 
 
 		 434 aa  248  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  35.23 
 
 		 433 aa  247  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  34.39 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  37.01 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  34.76 
 
 		 433 aa  247  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  33.85 
 
 		 449 aa  246  8e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  32.1 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  36.32 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  36.43 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  36.07 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  35.76 
 
 		 436 aa  243  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  37.67 
 
 		 432 aa  244  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  36.07 
 
 		 440 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  37.95 
 
 		 434 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  34.47 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  37.84 
 
 		 436 aa  242  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  35.16 
 
 		 433 aa  242  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  36.55 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  36.14 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  36.22 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  36.09 
 
 		 440 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  36.09 
 
 		 440 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  34.8 
 
 		 427 aa  239  5e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  34.92 
 
 		 432 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5019  phenylacetate--CoA ligase  35.7 
 
 		 477 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  37.67 
 
 		 434 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  35.86 
 
 		 440 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  33.79 
 
 		 433 aa  239  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  37.76 
 
 		 448 aa  239  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2897  Phenylacetate--CoA ligase  35.19 
 
 		 428 aa  239  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  34.55 
 
 		 439 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  35.65 
 
 		 439 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  35.81 
 
 		 436 aa  237  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  36.19 
 
 		 429 aa  236  5.0000000000000005e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  34.32 
 
 		 433 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  34.39 
 
 		 436 aa  236  7e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  33.26 
 
 		 433 aa  236  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  35.73 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  34.7 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  34.83 
 
 		 436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  32.96 
 
 		 449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  35.25 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  36.53 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>