More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0409 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  81.82 
 
 
447 aa  766    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 
447 aa  924    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  60.46 
 
 
440 aa  566  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  51.69 
 
 
445 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  51.69 
 
 
458 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  51.94 
 
 
445 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  50.11 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  50.11 
 
 
447 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  39.72 
 
 
438 aa  282  7.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  36.85 
 
 
430 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  40.32 
 
 
435 aa  278  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  39.23 
 
 
444 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  37.13 
 
 
432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  37.78 
 
 
434 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  38.78 
 
 
444 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  37.41 
 
 
434 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  35.25 
 
 
433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  38.22 
 
 
441 aa  270  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  37.27 
 
 
435 aa  269  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  37.53 
 
 
439 aa  269  8.999999999999999e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  37.81 
 
 
433 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  37.56 
 
 
434 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  36.59 
 
 
433 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  38.5 
 
 
444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  34.7 
 
 
432 aa  267  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  38.62 
 
 
440 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  35.25 
 
 
433 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  35.02 
 
 
433 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  38.27 
 
 
434 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  36.61 
 
 
439 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  35.23 
 
 
432 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  37.81 
 
 
434 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  38.39 
 
 
440 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  38.3 
 
 
440 aa  264  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  38.39 
 
 
440 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  37.64 
 
 
435 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  36.94 
 
 
443 aa  263  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  38.27 
 
 
434 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  36.82 
 
 
435 aa  262  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  38.16 
 
 
440 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  38.86 
 
 
433 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  37.59 
 
 
433 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  37.36 
 
 
446 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  36.65 
 
 
432 aa  261  3e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  37.81 
 
 
433 aa  260  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  36.38 
 
 
439 aa  260  4e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  37.73 
 
 
433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  37.67 
 
 
440 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  37.67 
 
 
440 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  37.44 
 
 
434 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  37.87 
 
 
435 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  35.45 
 
 
433 aa  257  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  34.57 
 
 
433 aa  258  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  39.26 
 
 
433 aa  258  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  37.5 
 
 
439 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  36.14 
 
 
433 aa  256  4e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  35.51 
 
 
433 aa  256  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  36.82 
 
 
433 aa  256  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  35.99 
 
 
434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  35.09 
 
 
436 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  35.28 
 
 
433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  38.68 
 
 
432 aa  253  6e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  38.9 
 
 
441 aa  252  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  33.79 
 
 
431 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  36.71 
 
 
433 aa  251  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  38.75 
 
 
436 aa  251  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  38.36 
 
 
448 aa  251  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  35.08 
 
 
434 aa  251  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  37.28 
 
 
442 aa  250  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  36.34 
 
 
437 aa  249  8e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  36.96 
 
 
429 aa  249  9e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  38.22 
 
 
433 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  36.05 
 
 
436 aa  248  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  35.54 
 
 
433 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  37.37 
 
 
435 aa  247  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  36.98 
 
 
433 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  34.93 
 
 
432 aa  247  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  38.24 
 
 
432 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  36.38 
 
 
436 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  36.22 
 
 
439 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  34.84 
 
 
436 aa  246  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  35.03 
 
 
449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  35.84 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  34.47 
 
 
432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  34.09 
 
 
428 aa  243  5e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  37.12 
 
 
429 aa  243  5e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2897  Phenylacetate--CoA ligase  35.88 
 
 
428 aa  242  7.999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  34.25 
 
 
432 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  33.86 
 
 
433 aa  242  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  35.91 
 
 
436 aa  242  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  35.08 
 
 
429 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  35 
 
 
449 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  35.96 
 
 
435 aa  241  2e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  36 
 
 
444 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  35.96 
 
 
427 aa  240  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  33.33 
 
 
433 aa  240  5e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  34.47 
 
 
439 aa  239  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  35.78 
 
 
431 aa  239  8e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  34.7 
 
 
433 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  36.81 
 
 
434 aa  238  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>