More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1456 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  100 
 
 		 433 aa  896    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  62.59 
 
 		 433 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  60.97 
 
 		 433 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  62.65 
 
 		 433 aa  558  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  60.28 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  54.99 
 
 		 434 aa  511  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  54.29 
 
 		 434 aa  509  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  55.32 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  50 
 
 		 434 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  49.77 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  50 
 
 		 434 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  50.94 
 
 		 438 aa  435  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  49.07 
 
 		 429 aa  435  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  50.82 
 
 		 434 aa  435  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  50.23 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  47.47 
 
 		 433 aa  433  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  48.02 
 
 		 431 aa  429  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  48.84 
 
 		 434 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  48.48 
 
 		 435 aa  428  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  48.49 
 
 		 434 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  48.95 
 
 		 432 aa  425  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  48.96 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  48.37 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  48.27 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  49.3 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  48.95 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  47.81 
 
 		 439 aa  424  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  48.03 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  48.14 
 
 		 434 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  47.24 
 
 		 433 aa  421  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  49.53 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  48.72 
 
 		 432 aa  425  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  46.64 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  47.67 
 
 		 429 aa  423  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  46.53 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  48.82 
 
 		 423 aa  420  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  47.67 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  48.95 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  47.11 
 
 		 439 aa  420  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  46.99 
 
 		 428 aa  421  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  47.34 
 
 		 439 aa  420  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  47.34 
 
 		 432 aa  420  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  47.92 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  48.48 
 
 		 433 aa  421  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  46.67 
 
 		 435 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  48.04 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  48.72 
 
 		 433 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  47.69 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  48.47 
 
 		 423 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  48.39 
 
 		 433 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  47.92 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  47.91 
 
 		 430 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  47.79 
 
 		 433 aa  414  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  45.39 
 
 		 436 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  48.58 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  47.22 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  48.82 
 
 		 441 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  45.12 
 
 		 436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  46.87 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  49.38 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  45.85 
 
 		 433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  48.35 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  47.69 
 
 		 444 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  46.48 
 
 		 433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  48.15 
 
 		 444 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  46.98 
 
 		 433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  45.85 
 
 		 433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  46.48 
 
 		 433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  46.17 
 
 		 432 aa  403  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  48.11 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  46.4 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  46.62 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  48.82 
 
 		 444 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  46.64 
 
 		 436 aa  405  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  45.75 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  47.1 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  45.54 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  46.73 
 
 		 437 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  45.69 
 
 		 436 aa  396  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  45.39 
 
 		 435 aa  398  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  44.57 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  47.92 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  45.83 
 
 		 443 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  46.7 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  47.61 
 
 		 431 aa  391  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  45.65 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  44.83 
 
 		 442 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  45.77 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1923  phenylacetate-CoA ligase  44.8 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0702505  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  47.65 
 
 		 431 aa  378  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  46.26 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  44.06 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  43.49 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  45.79 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  45.79 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  45.75 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  46.39 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  44.86 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  45.56 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  45.79 
 
 		 432 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>