More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2007 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  100 
 
 		 487 aa  1014    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  29.91 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.43 
 
 		 450 aa  154  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  28.02 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.46 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.64 
 
 		 475 aa  141  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  25.33 
 
 		 469 aa  136  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.11 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  29.92 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  26.41 
 
 		 446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  26.75 
 
 		 432 aa  127  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  26.35 
 
 		 433 aa  126  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  24.49 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  29.03 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  30.23 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  28.86 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  28.42 
 
 		 427 aa  120  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  26.98 
 
 		 435 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  27.73 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  26.27 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1908  phenylacetate-CoA ligase  28.71 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  24.89 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  28.37 
 
 		 439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 		 448 aa  117  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  25.75 
 
 		 448 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  26.22 
 
 		 433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.33 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  26.06 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  26.11 
 
 		 443 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  25.05 
 
 		 458 aa  113  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  26.16 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.92 
 
 		 563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  26.22 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  25.91 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  25.05 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0662  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.59 
 
 		 425 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  23.16 
 
 		 459 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  27.05 
 
 		 448 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  24.29 
 
 		 445 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  25.48 
 
 		 434 aa  110  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2875  phenylacetyl-CoA-ligase protein  25.7 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0228707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  26.95 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  24.12 
 
 		 431 aa  109  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  26.18 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  26.95 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  25.32 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  28.91 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  28.39 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  25.85 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  27.53 
 
 		 432 aa  108  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  25.27 
 
 		 434 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  24.78 
 
 		 502 aa  108  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  25.41 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  27.01 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  25.42 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  24.78 
 
 		 432 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3568  phenylacetate-CoA ligase  26.51 
 
 		 432 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172482  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  24.84 
 
 		 434 aa  107  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  25.12 
 
 		 433 aa  107  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  25.11 
 
 		 434 aa  107  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  22.81 
 
 		 442 aa  107  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  27.93 
 
 		 437 aa  106  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  25 
 
 		 432 aa  106  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0477  phenylacetate-CoA ligase  29.52 
 
 		 427 aa  106  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  24.77 
 
 		 433 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  25.32 
 
 		 430 aa  106  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  27.93 
 
 		 437 aa  106  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  25.21 
 
 		 432 aa  106  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  25.46 
 
 		 433 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3550  phenylacetate-CoA ligase  26.27 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489447  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  27.06 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539  phenylacetate-coenzyme A ligase  26.57 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0321632  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  27.62 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2034  phenylacetate-CoA ligase  27.03 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  27.73 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1905  phenylacetate-coenzyme A ligase  26.57 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511484  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0638  phenylacetate-CoA ligase  26.57 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0935  phenylacetate-coenzyme A ligase  26.57 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  24.15 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3577  phenylacetate-CoA ligase  26.27 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  27.45 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  27.75 
 
 		 432 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  28.57 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  24.68 
 
 		 432 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  24.68 
 
 		 432 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  27.7 
 
 		 437 aa  104  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  27.7 
 
 		 437 aa  104  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  24.49 
 
 		 451 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  25.3 
 
 		 433 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  25.33 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  28.38 
 
 		 439 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  27.02 
 
 		 432 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  26.33 
 
 		 447 aa  103  8e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  25.84 
 
 		 439 aa  103  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  26.42 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  27.93 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  27.74 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  27.51 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  26.88 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>