More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3269 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  100 
 
 
457 aa  920    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  65.48 
 
 
451 aa  607  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  67.34 
 
 
453 aa  587  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  60.8 
 
 
453 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  62.92 
 
 
459 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  50.67 
 
 
450 aa  428  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  48.21 
 
 
448 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  43.41 
 
 
461 aa  317  4e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  37.19 
 
 
437 aa  256  5e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.72 
 
 
454 aa  242  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  36.74 
 
 
445 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  31.65 
 
 
480 aa  226  7e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  31.92 
 
 
464 aa  211  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  33.57 
 
 
469 aa  208  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  31.11 
 
 
446 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  32.39 
 
 
453 aa  199  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  29.64 
 
 
441 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  29.72 
 
 
426 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  32.15 
 
 
475 aa  192  7e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  32.12 
 
 
458 aa  192  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.91 
 
 
450 aa  192  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  31.53 
 
 
502 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 
446 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.49 
 
 
448 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  28.3 
 
 
439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  29.18 
 
 
475 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  29.79 
 
 
461 aa  153  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  27.79 
 
 
467 aa  150  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.06 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  23.86 
 
 
437 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  28.54 
 
 
466 aa  147  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  22.69 
 
 
463 aa  139  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  27.83 
 
 
416 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  28.61 
 
 
433 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  28.61 
 
 
433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  27.36 
 
 
435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  29.71 
 
 
436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  29.73 
 
 
432 aa  130  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  26.48 
 
 
448 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  29.65 
 
 
433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  30.18 
 
 
438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  29.04 
 
 
479 aa  126  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  24.49 
 
 
487 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  26.79 
 
 
434 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  24.41 
 
 
448 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  27.69 
 
 
432 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  28.74 
 
 
447 aa  124  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  28.35 
 
 
433 aa  124  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  25.92 
 
 
476 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  27.49 
 
 
433 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  24.7 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4201  coenzyme F390 synthetase-like  29.88 
 
 
457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282456  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  28.19 
 
 
435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  25.8 
 
 
433 aa  120  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.79 
 
 
436 aa  120  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02970  possible capK protein  24.71 
 
 
435 aa  119  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240993  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  29.57 
 
 
427 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  26.67 
 
 
432 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  29.25 
 
 
430 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  27.38 
 
 
434 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  26.89 
 
 
433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  30.56 
 
 
434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  27.83 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  28.48 
 
 
431 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  27.63 
 
 
433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  26.88 
 
 
433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4305  CapK domain-containing protein  26.97 
 
 
481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  29.46 
 
 
434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  28.07 
 
 
434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  28.27 
 
 
433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  25.98 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  28.32 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  28.57 
 
 
434 aa  114  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  27.35 
 
 
434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  29.04 
 
 
442 aa  114  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  26.19 
 
 
433 aa  114  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  29.64 
 
 
435 aa  114  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  29.11 
 
 
428 aa  113  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  28.82 
 
 
435 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  27.33 
 
 
443 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  28.07 
 
 
433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  29.05 
 
 
524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  26.22 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  27.48 
 
 
436 aa  111  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  21.95 
 
 
563 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  27.49 
 
 
434 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  26.56 
 
 
433 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  24.71 
 
 
434 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  27.41 
 
 
428 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  29.72 
 
 
439 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.11 
 
 
429 aa  108  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  26.2 
 
 
433 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  34.34 
 
 
461 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  27.91 
 
 
435 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  29.41 
 
 
439 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  23.85 
 
 
460 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  27.51 
 
 
435 aa  107  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  28.41 
 
 
434 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  25.5 
 
 
433 aa  107  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0797552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>