More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1074 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 		 461 aa  924    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4216  coenzyme F390 synthetase-like  42.47 
 
 		 456 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4480  coenzyme F390 synthetase-like protein  41.65 
 
 		 454 aa  309  6.999999999999999e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4311  coenzyme F390 synthetase-like protein  41.65 
 
 		 454 aa  309  6.999999999999999e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0828925  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4211  coenzyme F390 synthetase-like protein  41.65 
 
 		 454 aa  309  6.999999999999999e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.494942  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  41.18 
 
 		 480 aa  282  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  40.45 
 
 		 460 aa  272  9e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  41 
 
 		 466 aa  260  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4394  coenzyme F390 synthetase-like protein  49.81 
 
 		 268 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  29.46 
 
 		 563 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1959  coenzyme F390 synthetase-like  41.38 
 
 		 239 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  29.29 
 
 		 472 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  32.33 
 
 		 468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  29.39 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  28.82 
 
 		 450 aa  126  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.37 
 
 		 464 aa  122  9e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4395  hypothetical protein  45.77 
 
 		 198 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  29.39 
 
 		 457 aa  116  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  32.42 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.86 
 
 		 475 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1919  hypothetical protein  24.4 
 
 		 493 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1908  hypothetical protein  24.4 
 
 		 493 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  27.19 
 
 		 451 aa  110  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  29.68 
 
 		 462 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.77 
 
 		 450 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0076  coenzyme F390 synthetase  22.3 
 
 		 442 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.743579  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  28.23 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  25.24 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  33.21 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.42 
 
 		 436 aa  106  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  31.73 
 
 		 469 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  29.43 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  24.4 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  27.19 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0374  putative adenylate-forming enzyme  24.77 
 
 		 433 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.56 
 
 		 454 aa  103  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2999  coenzyme F390 synthetase  23.66 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3245  hypothetical protein  23.41 
 
 		 445 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3014  hypothetical protein  23.41 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3246  hypothetical protein  23.41 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  32.41 
 
 		 439 aa  100  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  26.08 
 
 		 446 aa  100  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2955  putative adenylate-forming enzyme  23.31 
 
 		 445 aa  99.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  31.56 
 
 		 475 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  27.81 
 
 		 437 aa  96.7  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2936  hypothetical protein  23.06 
 
 		 445 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  28.98 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  26.29 
 
 		 476 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  27.79 
 
 		 427 aa  93.6  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  31.35 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.64 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  26.32 
 
 		 479 aa  89.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  29.24 
 
 		 426 aa  89  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  25.81 
 
 		 432 aa  87  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  24.89 
 
 		 480 aa  86.7  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  25 
 
 		 447 aa  86.3  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  31.39 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  27.79 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  26.17 
 
 		 466 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2214  adenylate-forming enzyme  24.93 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.362513  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  26.96 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.23 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3110  adenylate-forming enzyme  21.33 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00628752  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  32.96 
 
 		 455 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  25.43 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  30.29 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2503  hypothetical protein  24.66 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239215 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  25.94 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  26.82 
 
 		 502 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2104  hypothetical protein  24.66 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  24.94 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4305  CapK domain-containing protein  31.6 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  25.43 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0672  putative adenylate-forming enzyme  25.73 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393226  normal  0.19612 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0437  Phenylacetate--CoA ligase  25.12 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  23.83 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  25.82 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1132  Phenylacetate--CoA ligase  30.69 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  23.72 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3434  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.18 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  25.44 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  33.95 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  24.44 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1652  coenzyme F390 synthetase-like  24.02 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  29.08 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  24.69 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  22.51 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  23.04 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  24.68 
 
 		 425 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  23.79 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  25.42 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4139  adenylate-forming enzyme  26.4 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  25.24 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5790  phenylacetate--CoA ligase  26.13 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  28.57 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  23.31 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.18 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  25.38 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  25.47 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3634  phenylacetate-CoA ligase  25.65 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>