More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5790 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5790  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 416 aa  863    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  53.09 
 
 		 429 aa  471  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  51.1 
 
 		 429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0133  Phenylacetate--CoA ligase  50.49 
 
 		 436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0426675  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1877  coenzyme F390 synthetase-like protein  51.83 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2125  phenylacetate-CoA ligase  51.39 
 
 		 427 aa  428  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  43.07 
 
 		 436 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  32.14 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  33.76 
 
 		 432 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  31.62 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  31.31 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  31.79 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  33.68 
 
 		 430 aa  179  8e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  30.84 
 
 		 414 aa  179  8e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  33.16 
 
 		 434 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  30.87 
 
 		 434 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  30.39 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  30.05 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  32 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  32.21 
 
 		 439 aa  169  6e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  30.9 
 
 		 432 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  29.18 
 
 		 433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  31.33 
 
 		 439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  28.57 
 
 		 433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  29.1 
 
 		 438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  30.85 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  30.77 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  30.81 
 
 		 439 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  30.56 
 
 		 413 aa  164  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  30.77 
 
 		 415 aa  162  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  27.85 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  30.47 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  30.28 
 
 		 433 aa  160  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  28.8 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  27.99 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  30.77 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  32.41 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  30.95 
 
 		 435 aa  157  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  30.14 
 
 		 434 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  27.08 
 
 		 433 aa  156  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  31.22 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  29.43 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  30.9 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  29.2 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  29.75 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  33.06 
 
 		 432 aa  153  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  28.26 
 
 		 428 aa  153  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  27.99 
 
 		 435 aa  152  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  31.49 
 
 		 438 aa  152  8e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  28.68 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  29.02 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  28.61 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  29.08 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  29.86 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  29.92 
 
 		 441 aa  149  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  30.71 
 
 		 434 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  29.74 
 
 		 445 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  27.9 
 
 		 431 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  30.61 
 
 		 433 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  30.15 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  30.03 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  28.5 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  30.34 
 
 		 428 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  29.55 
 
 		 429 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  30.14 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  27.93 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  30.61 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  29.26 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  30.4 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  28.22 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  28.96 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  29.5 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  28.68 
 
 		 433 aa  146  5e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  29.84 
 
 		 423 aa  146  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1585  Phenylacetate--CoA ligase  29.52 
 
 		 457 aa  146  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0730683 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0437  Phenylacetate--CoA ligase  29.14 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288534  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  29.18 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  31.65 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  31.63 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  29.32 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  27.61 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  29.25 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  30.62 
 
 		 436 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  29.17 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  28.15 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  28.53 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  28.67 
 
 		 445 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  30.05 
 
 		 430 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  27.92 
 
 		 442 aa  143  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  29.51 
 
 		 439 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  28.75 
 
 		 433 aa  142  8e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  30.79 
 
 		 444 aa  142  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  28.43 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  28.13 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  31.05 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  28.31 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  29.21 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  28.68 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  31.34 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  30.28 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>