More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2125 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2125  phenylacetate-CoA ligase  100 
 
 		 427 aa  890    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  51.78 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  51.2 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5790  phenylacetate--CoA ligase  51.39 
 
 		 416 aa  428  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0133  Phenylacetate--CoA ligase  48.46 
 
 		 436 aa  423  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0426675  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1877  coenzyme F390 synthetase-like protein  47.29 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  39.44 
 
 		 436 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  30.86 
 
 		 413 aa  176  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  29.43 
 
 		 434 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  30.59 
 
 		 415 aa  170  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  30.58 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  31.23 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  26.57 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  29.7 
 
 		 430 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  30.11 
 
 		 433 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  29.49 
 
 		 433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  30.94 
 
 		 432 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  30.6 
 
 		 438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  29.67 
 
 		 427 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  29.28 
 
 		 413 aa  163  7e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  29.49 
 
 		 433 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  28.92 
 
 		 434 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  30.94 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  30.71 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  27.83 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  29.62 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  30.9 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  27.69 
 
 		 432 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  27.25 
 
 		 434 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1585  Phenylacetate--CoA ligase  27.12 
 
 		 457 aa  160  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0730683 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  29.87 
 
 		 414 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  30.47 
 
 		 415 aa  159  8e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  31.07 
 
 		 447 aa  159  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  26.47 
 
 		 431 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  30.31 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  30.11 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  28.94 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  27.64 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  29.29 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  28.03 
 
 		 444 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  29.89 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  28.86 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  30.29 
 
 		 434 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  28.95 
 
 		 434 aa  157  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  30.83 
 
 		 433 aa  156  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  27.79 
 
 		 444 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  31.06 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  29.65 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  28.68 
 
 		 433 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  29.35 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  27.1 
 
 		 439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  30.13 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  28.49 
 
 		 433 aa  153  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  29.11 
 
 		 432 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  30.47 
 
 		 432 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  26.68 
 
 		 433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  27.37 
 
 		 439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1721  Phenylacetate--CoA ligase  29.75 
 
 		 431 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  29.79 
 
 		 435 aa  153  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  28.41 
 
 		 443 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  29.25 
 
 		 412 aa  152  8e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  29.41 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  28.69 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  29.46 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  28.15 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  28.84 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  28.84 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  29.13 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  28.38 
 
 		 433 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  27.68 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539  phenylacetate-coenzyme A ligase  29.38 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0321632  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1905  phenylacetate-coenzyme A ligase  29.38 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511484  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0935  phenylacetate-coenzyme A ligase  29.38 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0638  phenylacetate-CoA ligase  29.38 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100652  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  28.09 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  28.16 
 
 		 439 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  27.52 
 
 		 448 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  29.11 
 
 		 432 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  28.35 
 
 		 433 aa  150  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  28.84 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  29.26 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  29.11 
 
 		 428 aa  150  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  29.11 
 
 		 432 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  29.11 
 
 		 432 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  27.39 
 
 		 435 aa  149  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  28.03 
 
 		 444 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  27.97 
 
 		 433 aa  149  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  28.09 
 
 		 436 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3550  phenylacetate-CoA ligase  29.38 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489447  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3568  phenylacetate-CoA ligase  29.38 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172482  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3577  phenylacetate-CoA ligase  29.38 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  27.7 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  27.47 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  28.4 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  27.2 
 
 		 435 aa  147  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  30.52 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  28.65 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  28.84 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  28.57 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  26.75 
 
 		 446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>