More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0910 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 		 436 aa  890    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  42.34 
 
 		 429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5790  phenylacetate--CoA ligase  43.4 
 
 		 416 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0133  Phenylacetate--CoA ligase  40.18 
 
 		 436 aa  339  7e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0426675  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  39.53 
 
 		 429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2125  phenylacetate-CoA ligase  39.44 
 
 		 427 aa  327  3e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1877  coenzyme F390 synthetase-like protein  39.9 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  33.56 
 
 		 438 aa  220  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  34.04 
 
 		 430 aa  202  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  32.55 
 
 		 434 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  32 
 
 		 433 aa  195  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  28.9 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  33.94 
 
 		 432 aa  193  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  33.57 
 
 		 434 aa  193  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  31.74 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  31.51 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  31.2 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  30.16 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  31.16 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  30.81 
 
 		 433 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  28.95 
 
 		 433 aa  182  9.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  30.64 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  32.57 
 
 		 432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  31.95 
 
 		 432 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  30.82 
 
 		 432 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  32.89 
 
 		 436 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  31.61 
 
 		 433 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  30.71 
 
 		 433 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  34.02 
 
 		 447 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  30.75 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  31.59 
 
 		 413 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  28.64 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  30.18 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  31.65 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  31.48 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  30.81 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  31.38 
 
 		 445 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  31.41 
 
 		 430 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  31.68 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  29.77 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  27.85 
 
 		 432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  29.84 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  31.65 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  32.81 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  28.89 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  32.19 
 
 		 432 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  31.29 
 
 		 440 aa  173  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  31.88 
 
 		 428 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  31.16 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  31.51 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  29.46 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  31.21 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  29.98 
 
 		 412 aa  171  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  30.9 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  31.65 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  27.61 
 
 		 433 aa  170  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  31.66 
 
 		 432 aa  170  4e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  30.84 
 
 		 442 aa  170  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  31.57 
 
 		 430 aa  170  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  30.71 
 
 		 449 aa  169  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  30.09 
 
 		 423 aa  169  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  31.03 
 
 		 444 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  30.26 
 
 		 445 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  31.31 
 
 		 435 aa  169  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  31.38 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  31.75 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  31.21 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  31.03 
 
 		 435 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  35.09 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  30.45 
 
 		 433 aa  168  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  30.66 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  30.68 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  30.18 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  29 
 
 		 439 aa  167  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  31.66 
 
 		 432 aa  167  5e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  29.81 
 
 		 432 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  32.32 
 
 		 437 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  32.28 
 
 		 449 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  29.45 
 
 		 447 aa  166  8e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  32.48 
 
 		 434 aa  166  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  31.3 
 
 		 433 aa  166  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  30.24 
 
 		 433 aa  166  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  28.77 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  30.88 
 
 		 427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  31.03 
 
 		 433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  28.5 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  31.35 
 
 		 444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  30.85 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  26.04 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  30.61 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  30.65 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1585  Phenylacetate--CoA ligase  31.84 
 
 		 457 aa  163  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0730683 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  28.54 
 
 		 447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  32.04 
 
 		 429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  28.08 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  29.23 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  29.43 
 
 		 433 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  26.51 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  32.73 
 
 		 438 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  31.7 
 
 		 435 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>