More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03810 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 		 429 aa  891    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  68.93 
 
 		 429 aa  626  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0133  Phenylacetate--CoA ligase  60.84 
 
 		 436 aa  563  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0426675  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1877  coenzyme F390 synthetase-like protein  54.8 
 
 		 429 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5790  phenylacetate--CoA ligase  51.63 
 
 		 416 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2125  phenylacetate-CoA ligase  52.99 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  39.53 
 
 		 436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  33.83 
 
 		 434 aa  224  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  29.21 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  28.68 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  29.95 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  31.48 
 
 		 439 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  28.78 
 
 		 438 aa  182  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  33.25 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  29.25 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  28.74 
 
 		 433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  31.22 
 
 		 439 aa  180  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  30.47 
 
 		 436 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  30.43 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  30.52 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  30.14 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  27.36 
 
 		 433 aa  176  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  28.93 
 
 		 432 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  29.9 
 
 		 433 aa  176  8e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  30.95 
 
 		 439 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  28.92 
 
 		 433 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  28.57 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  33.33 
 
 		 433 aa  170  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  29.7 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  30.62 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  29.16 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  33.05 
 
 		 433 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  32.87 
 
 		 433 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  31.64 
 
 		 433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  29.25 
 
 		 434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  27.71 
 
 		 430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  29.81 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  27.5 
 
 		 432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  29.76 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  29.68 
 
 		 434 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2897  Phenylacetate--CoA ligase  28.04 
 
 		 428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  29.46 
 
 		 432 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  29.75 
 
 		 432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  28.39 
 
 		 433 aa  163  6e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  29.63 
 
 		 441 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  28.68 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  27.91 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  28.74 
 
 		 433 aa  161  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  29.66 
 
 		 433 aa  160  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  29.57 
 
 		 429 aa  160  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  27.38 
 
 		 433 aa  159  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  29.35 
 
 		 430 aa  159  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  27.85 
 
 		 449 aa  159  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  28.97 
 
 		 434 aa  159  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  28.82 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  27.46 
 
 		 433 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  28.97 
 
 		 434 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  29.8 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  28.65 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  28.86 
 
 		 442 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  29.86 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  28.78 
 
 		 437 aa  157  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  29.76 
 
 		 432 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  29.41 
 
 		 423 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  27.23 
 
 		 430 aa  156  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  26.47 
 
 		 445 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  27.84 
 
 		 428 aa  156  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  28.05 
 
 		 444 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  28.67 
 
 		 413 aa  156  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  27.17 
 
 		 440 aa  156  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0437  Phenylacetate--CoA ligase  28.77 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288534  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  28.9 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  27.75 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1845  phenylacetate-CoA ligase  28.05 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  28.21 
 
 		 449 aa  155  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  28.08 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  29.31 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  28.16 
 
 		 447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  26.95 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  27.89 
 
 		 444 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  27.71 
 
 		 447 aa  153  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  29.19 
 
 		 433 aa  153  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  25.9 
 
 		 431 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  27.31 
 
 		 432 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1721  Phenylacetate--CoA ligase  28.81 
 
 		 431 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  29.82 
 
 		 433 aa  153  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  28.97 
 
 		 429 aa  153  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1132  Phenylacetate--CoA ligase  26.38 
 
 		 418 aa  152  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  31.03 
 
 		 415 aa  152  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  30.73 
 
 		 414 aa  152  8e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  27.82 
 
 		 434 aa  152  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  26.67 
 
 		 444 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  27.25 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  27.89 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  29.75 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  28.25 
 
 		 446 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  28.94 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  27.23 
 
 		 433 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  29.12 
 
 		 434 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  30.26 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>