More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0437 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0437  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 435 aa  880    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288534  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0388  phenylacetate-CoA ligase  68.93 
 
 		 427 aa  591  1e-167  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.128203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  45.01 
 
 		 433 aa  351  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  43.51 
 
 		 433 aa  345  8e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  43.05 
 
 		 435 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  43.02 
 
 		 435 aa  338  8e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  42.26 
 
 		 432 aa  338  8e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  43.35 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  45.27 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  45.92 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  43.62 
 
 		 438 aa  333  4e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  43.65 
 
 		 433 aa  333  4e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  44.14 
 
 		 435 aa  332  6e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  42.37 
 
 		 434 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  42.14 
 
 		 434 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  43.05 
 
 		 434 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  42.37 
 
 		 434 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  44.11 
 
 		 434 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  40.77 
 
 		 433 aa  329  7e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  43.22 
 
 		 433 aa  329  8e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  43.22 
 
 		 433 aa  328  8e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  41.91 
 
 		 435 aa  328  9e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  42.53 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  43.66 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  42.23 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  43.22 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  42.2 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  42.26 
 
 		 432 aa  327  3e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  43.45 
 
 		 434 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  43.22 
 
 		 434 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  42.99 
 
 		 433 aa  326  6e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  42.49 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  41.9 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  42.13 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  42.79 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  42.26 
 
 		 432 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  42.26 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  42.11 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  42.26 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  41.9 
 
 		 436 aa  323  4e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  42.49 
 
 		 432 aa  323  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  43.09 
 
 		 436 aa  323  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  41.11 
 
 		 433 aa  322  7e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  42.72 
 
 		 434 aa  322  8e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  44.5 
 
 		 432 aa  322  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  42.03 
 
 		 433 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  41.97 
 
 		 430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  43.02 
 
 		 432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  41.12 
 
 		 433 aa  319  6e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  40.84 
 
 		 433 aa  319  6e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  41.55 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  43.41 
 
 		 414 aa  317  3e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  43.17 
 
 		 414 aa  317  4e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  41.63 
 
 		 433 aa  316  5e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  41.11 
 
 		 439 aa  316  6e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  40.92 
 
 		 431 aa  315  7e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  41.72 
 
 		 434 aa  315  9e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  41.74 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  39.86 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  41.11 
 
 		 439 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  41.76 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  41.63 
 
 		 423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  40.84 
 
 		 439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  40.05 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  40.88 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  41.11 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  41.61 
 
 		 439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  42.93 
 
 		 414 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  41.44 
 
 		 439 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  41.55 
 
 		 433 aa  312  1e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  41.9 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  41.53 
 
 		 432 aa  311  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  40.65 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  43.06 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  41.38 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  40.36 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1509  phenylacetate-CoA ligase  40.5 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.047551  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  39.73 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  39.49 
 
 		 439 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  41.61 
 
 		 439 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  39.41 
 
 		 434 aa  308  9e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  40.37 
 
 		 437 aa  308  9e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  42.07 
 
 		 435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  40.65 
 
 		 436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  40.64 
 
 		 433 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  39.41 
 
 		 434 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  40.36 
 
 		 439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  41.01 
 
 		 434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  40.64 
 
 		 437 aa  306  6e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  40.64 
 
 		 437 aa  306  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2875  phenylacetyl-CoA-ligase protein  40.09 
 
 		 436 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0228707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  40.64 
 
 		 437 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  40 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  39.53 
 
 		 443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  41.51 
 
 		 442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  41.27 
 
 		 430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  40.41 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  38.75 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  41.07 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  40.75 
 
 		 444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>