More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0388 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0388  phenylacetate-CoA ligase  100 
 
 		 427 aa  867    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.128203  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0437  Phenylacetate--CoA ligase  68.93 
 
 		 435 aa  620  1e-176  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  44.76 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  43.08 
 
 		 432 aa  340  4e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  44.55 
 
 		 434 aa  338  9e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  44.06 
 
 		 443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  42.69 
 
 		 433 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  44.44 
 
 		 433 aa  335  9e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  46.62 
 
 		 433 aa  334  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  41.86 
 
 		 432 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  42.13 
 
 		 432 aa  332  1e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  42.13 
 
 		 432 aa  332  1e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  43.55 
 
 		 435 aa  331  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  43.59 
 
 		 435 aa  331  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  44.06 
 
 		 433 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  44.29 
 
 		 433 aa  331  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  42.79 
 
 		 435 aa  330  4e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  44.98 
 
 		 435 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  40.73 
 
 		 434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  43.03 
 
 		 434 aa  329  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  43.99 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  42.76 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  41.3 
 
 		 433 aa  325  7e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  42.82 
 
 		 433 aa  325  9e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  41.07 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  44.11 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  43.09 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  42.08 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  42.82 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  44.42 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  42.96 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  42.73 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  41.07 
 
 		 433 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  42.18 
 
 		 439 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  42.59 
 
 		 443 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  43.09 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  43.09 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  43.09 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  41.07 
 
 		 433 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  42.34 
 
 		 439 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  43.09 
 
 		 432 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  42.86 
 
 		 432 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  42.86 
 
 		 434 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  41.32 
 
 		 434 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  42.62 
 
 		 432 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  41.7 
 
 		 446 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  42.13 
 
 		 436 aa  322  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  42.82 
 
 		 439 aa  320  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  41.44 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  41.67 
 
 		 439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  43.09 
 
 		 434 aa  319  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  41.32 
 
 		 435 aa  319  7e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  40.97 
 
 		 433 aa  319  7e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  43.84 
 
 		 434 aa  319  7e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  42.49 
 
 		 434 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  42.86 
 
 		 432 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  42.25 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  43.95 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  42.89 
 
 		 434 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  41.14 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  40.68 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  43.33 
 
 		 432 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  43.26 
 
 		 432 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  40.91 
 
 		 433 aa  318  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  41.67 
 
 		 436 aa  316  5e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  43.87 
 
 		 435 aa  316  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  40.45 
 
 		 434 aa  316  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  42.34 
 
 		 433 aa  316  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  41.32 
 
 		 434 aa  315  8e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  41.61 
 
 		 434 aa  315  8e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  42.89 
 
 		 432 aa  315  9e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  42.11 
 
 		 433 aa  315  9e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  41.55 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  41.1 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  42.11 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  41.63 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  43.48 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  41.41 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  40.18 
 
 		 432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  40.05 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  39.68 
 
 		 439 aa  313  4.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2875  phenylacetyl-CoA-ligase protein  42.08 
 
 		 436 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0228707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  41.92 
 
 		 434 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  41.92 
 
 		 436 aa  312  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  42.18 
 
 		 444 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  41.11 
 
 		 436 aa  312  6.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2870  phenylacetate-CoA ligase  42.55 
 
 		 442 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  39.26 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  41.92 
 
 		 434 aa  311  1e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3634  phenylacetate-CoA ligase  42.25 
 
 		 444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  40.42 
 
 		 434 aa  309  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  41.46 
 
 		 414 aa  309  5e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  41.22 
 
 		 441 aa  309  6.999999999999999e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1923  phenylacetate-CoA ligase  41.53 
 
 		 443 aa  308  8e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0702505  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  41.57 
 
 		 434 aa  308  9e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  40.77 
 
 		 430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  39.44 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  39.44 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  40.05 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  40.97 
 
 		 431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>