More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1877 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1877  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 		 429 aa  898    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  54.8 
 
 		 429 aa  513  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  52.46 
 
 		 429 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0133  Phenylacetate--CoA ligase  53.27 
 
 		 436 aa  488  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0426675  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5790  phenylacetate--CoA ligase  52.38 
 
 		 416 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2125  phenylacetate-CoA ligase  48.76 
 
 		 427 aa  430  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  39.9 
 
 		 436 aa  324  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  27.85 
 
 		 434 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  26.98 
 
 		 432 aa  160  6e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  28.08 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  27.93 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  29.65 
 
 		 430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  25.85 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  25.97 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  27.56 
 
 		 436 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  27.41 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  25.9 
 
 		 442 aa  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  28.54 
 
 		 439 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  27.4 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  28.09 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  24.36 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  26.53 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  25.74 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  27.97 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  25.85 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  27.25 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  28.76 
 
 		 439 aa  145  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  29.43 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  27.8 
 
 		 433 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  25 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  28.15 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  24.94 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  26.21 
 
 		 427 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  26.41 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  24.75 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  27.62 
 
 		 439 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  24.83 
 
 		 432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  26.83 
 
 		 433 aa  139  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  25.06 
 
 		 432 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  27.32 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  26.81 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  28.11 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  26.61 
 
 		 427 aa  139  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  24.39 
 
 		 435 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  26.83 
 
 		 428 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  25.23 
 
 		 433 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  26.46 
 
 		 428 aa  136  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  25.86 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  24.6 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  29.39 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  25.23 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  26.75 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  25.29 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  28.37 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  24.21 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  24.6 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  27.52 
 
 		 434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  27.54 
 
 		 438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  28.06 
 
 		 434 aa  133  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1721  Phenylacetate--CoA ligase  29.18 
 
 		 431 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  27.81 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  26.01 
 
 		 414 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1585  Phenylacetate--CoA ligase  25.55 
 
 		 457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0730683 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  27.52 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  27.49 
 
 		 414 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  25.99 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  28.44 
 
 		 435 aa  131  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  26.88 
 
 		 440 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  28.44 
 
 		 429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  24.77 
 
 		 425 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  25.07 
 
 		 437 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  25.55 
 
 		 432 aa  129  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2897  Phenylacetate--CoA ligase  28.53 
 
 		 428 aa  129  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  24.82 
 
 		 434 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  26.82 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  29.41 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  25.41 
 
 		 436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  27.05 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  24.77 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  25.81 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  28.03 
 
 		 445 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  28.03 
 
 		 426 aa  127  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  25.69 
 
 		 435 aa  126  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  24.59 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  26.98 
 
 		 436 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1592  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  26.63 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1845  phenylacetate-CoA ligase  26.87 
 
 		 440 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  25.68 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  27.83 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  27.36 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  26.41 
 
 		 427 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  27.36 
 
 		 433 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  23.9 
 
 		 439 aa  123  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  25.31 
 
 		 432 aa  123  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  27.1 
 
 		 428 aa  123  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  25.06 
 
 		 433 aa  123  8e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  28 
 
 		 434 aa  122  9e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  23.79 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  28.61 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  23.7 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>