More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1845 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1845  phenylacetate-CoA ligase  100 
 
 		 440 aa  901    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1851  phenylacetate-CoA ligase  45.85 
 
 		 449 aa  351  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  39.46 
 
 		 434 aa  262  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  39.36 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  38.88 
 
 		 433 aa  249  5e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  36.65 
 
 		 433 aa  245  9e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  36.85 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  39.76 
 
 		 433 aa  244  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  37.13 
 
 		 434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  35.91 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  37.05 
 
 		 431 aa  240  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  36.28 
 
 		 434 aa  240  5e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  38.52 
 
 		 432 aa  240  5e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  39.39 
 
 		 435 aa  239  9e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  39.02 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  37.53 
 
 		 433 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  37.53 
 
 		 433 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  34.62 
 
 		 433 aa  236  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  37.47 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  38.23 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  38.72 
 
 		 458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  34.86 
 
 		 445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  34.55 
 
 		 440 aa  234  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  36.88 
 
 		 436 aa  233  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  38.44 
 
 		 432 aa  232  8.000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  36.79 
 
 		 433 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  37.13 
 
 		 435 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  37.3 
 
 		 433 aa  232  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  38.78 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  36.79 
 
 		 433 aa  231  3e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  36.32 
 
 		 433 aa  229  6e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  38.93 
 
 		 433 aa  229  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  37.38 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  37.44 
 
 		 432 aa  229  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  37.96 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  37.2 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  37.24 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  35.92 
 
 		 433 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  36.05 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  37.2 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  37.62 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  36.18 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  36.38 
 
 		 433 aa  226  6e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  34.17 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  36.01 
 
 		 429 aa  225  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  37.73 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  36.81 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  37.38 
 
 		 441 aa  224  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  37.59 
 
 		 434 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  34.95 
 
 		 436 aa  223  4.9999999999999996e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  37.56 
 
 		 432 aa  223  7e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  38.37 
 
 		 433 aa  222  8e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  37.5 
 
 		 432 aa  222  9e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  35.61 
 
 		 435 aa  221  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  35.55 
 
 		 428 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  36.05 
 
 		 435 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  36.41 
 
 		 428 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  37.21 
 
 		 436 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  36.93 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  34.31 
 
 		 447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  33.26 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  36.97 
 
 		 432 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  36.92 
 
 		 434 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  35.04 
 
 		 449 aa  220  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  37.73 
 
 		 441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  37.87 
 
 		 435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2684  phenylacetate--CoA ligase  33.72 
 
 		 460 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  37.94 
 
 		 434 aa  219  6e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  33.86 
 
 		 447 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  38.17 
 
 		 427 aa  219  6e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  32.88 
 
 		 447 aa  219  7.999999999999999e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  37.19 
 
 		 435 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  35.68 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  36.88 
 
 		 429 aa  219  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  37.8 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  35.78 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  35.19 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  37.5 
 
 		 441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  37.5 
 
 		 441 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  40.81 
 
 		 446 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  36.26 
 
 		 428 aa  216  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  36.2 
 
 		 435 aa  216  7e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  35.2 
 
 		 441 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1585  Phenylacetate--CoA ligase  33.72 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0730683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  36.97 
 
 		 445 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  34.12 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  34.53 
 
 		 449 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  35.38 
 
 		 433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  41.44 
 
 		 444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  35.71 
 
 		 443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  36.23 
 
 		 437 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3568  phenylacetate-CoA ligase  37.77 
 
 		 432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172482  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3550  phenylacetate-CoA ligase  37.77 
 
 		 432 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489447  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  37.5 
 
 		 432 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3247  phenylacetate-CoA ligase  35.35 
 
 		 444 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3577  phenylacetate-CoA ligase  37.77 
 
 		 432 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  34.7 
 
 		 434 aa  213  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  34.49 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  36.26 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  34.51 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>