More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1075 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 429 aa  888    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  68.93 
 
 		 429 aa  626  1e-178  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0133  Phenylacetate--CoA ligase  65.03 
 
 		 436 aa  590  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0426675  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1877  coenzyme F390 synthetase-like protein  52.46 
 
 		 429 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5790  phenylacetate--CoA ligase  53.42 
 
 		 416 aa  465  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2125  phenylacetate-CoA ligase  51.72 
 
 		 427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  42.34 
 
 		 436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  33.25 
 
 		 434 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  30.86 
 
 		 438 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  32.13 
 
 		 436 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  30.68 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  28.54 
 
 		 434 aa  187  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  30.47 
 
 		 430 aa  186  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  32.11 
 
 		 439 aa  184  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  31.58 
 
 		 439 aa  183  6e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1585  Phenylacetate--CoA ligase  31.59 
 
 		 457 aa  182  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0730683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  28.78 
 
 		 444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  32.15 
 
 		 439 aa  180  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  29.63 
 
 		 434 aa  176  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  31.14 
 
 		 433 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  28.43 
 
 		 433 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  27.45 
 
 		 433 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  28.81 
 
 		 433 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  29.38 
 
 		 434 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  27.82 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  27.75 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  26.97 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  29.55 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  27.78 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  29.31 
 
 		 433 aa  169  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  29.13 
 
 		 433 aa  170  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  28.73 
 
 		 433 aa  169  8e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  28.85 
 
 		 434 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  29.1 
 
 		 434 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  28.05 
 
 		 444 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  26.75 
 
 		 437 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  30.1 
 
 		 433 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  29.36 
 
 		 432 aa  166  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  28.76 
 
 		 434 aa  166  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  28.47 
 
 		 433 aa  166  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  29.77 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  28.46 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  29.26 
 
 		 434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  29.05 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  28.72 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  28.83 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  28.84 
 
 		 413 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  27.58 
 
 		 432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  29.83 
 
 		 441 aa  163  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  28 
 
 		 435 aa  163  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  30.97 
 
 		 433 aa  162  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  32.23 
 
 		 429 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  30.71 
 
 		 428 aa  162  9e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  29.59 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  29.3 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  28.88 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  30.52 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  30.25 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  26.51 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  30.03 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  28.61 
 
 		 435 aa  161  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  28.72 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  30.08 
 
 		 427 aa  160  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  28.41 
 
 		 434 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  30.29 
 
 		 433 aa  160  6e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  30.39 
 
 		 443 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  30.05 
 
 		 430 aa  159  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  27.99 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  27.25 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  29.07 
 
 		 442 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  28.34 
 
 		 432 aa  157  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  28.2 
 
 		 435 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  29.05 
 
 		 434 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  28.86 
 
 		 435 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  27.71 
 
 		 432 aa  156  6e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  26.72 
 
 		 446 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  27.39 
 
 		 432 aa  156  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  30.47 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  28.91 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  28.64 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  28.26 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  28.38 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  27.86 
 
 		 436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  27.36 
 
 		 433 aa  154  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  30.63 
 
 		 436 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  26.32 
 
 		 433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  27.53 
 
 		 428 aa  153  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  29.23 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  26.17 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  26.84 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  27.46 
 
 		 434 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  26.73 
 
 		 441 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  30.05 
 
 		 438 aa  151  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  26.65 
 
 		 441 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  27.71 
 
 		 694 aa  150  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  28.49 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  29.23 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2152  Phenylacetate--CoA ligase  27.18 
 
 		 446 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  26.73 
 
 		 441 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  26.73 
 
 		 441 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>