More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2454 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  100 
 
 		 458 aa  957    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  32.97 
 
 		 475 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  35.58 
 
 		 464 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  34.73 
 
 		 475 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.33 
 
 		 450 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  32.83 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  30.13 
 
 		 461 aa  229  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  31.75 
 
 		 446 aa  229  7e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  32.61 
 
 		 469 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  33.08 
 
 		 451 aa  225  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  31.38 
 
 		 453 aa  221  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  32.12 
 
 		 457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  28.45 
 
 		 463 aa  216  7e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  29.55 
 
 		 453 aa  204  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  28.98 
 
 		 480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  29.77 
 
 		 459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  29.29 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  30 
 
 		 416 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  28.97 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  29.61 
 
 		 445 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  28.31 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  27.96 
 
 		 448 aa  172  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.51 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0472  putative capK protein  25.37 
 
 		 459 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000021402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00696  hypothetical protein  27.51 
 
 		 417 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.84 
 
 		 437 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.22 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  27.34 
 
 		 502 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  30.14 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.75 
 
 		 439 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.59 
 
 		 448 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  26.85 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  29.93 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  25.81 
 
 		 437 aa  142  9e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2156  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.33 
 
 		 459 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.98 
 
 		 461 aa  136  8e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  28.17 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  24.79 
 
 		 487 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  27.63 
 
 		 479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.12 
 
 		 563 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  26.8 
 
 		 460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.95 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  29.58 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.57 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  24.94 
 
 		 476 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  25.96 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4305  CapK domain-containing protein  24.89 
 
 		 481 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  27.95 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0662  Coenzyme F390 synthetase-like protein  23.89 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  29.79 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  25.84 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  27.62 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.6 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  28.37 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  28.41 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  26.3 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  28.37 
 
 		 432 aa  104  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.65 
 
 		 429 aa  103  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  29.22 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  26.76 
 
 		 442 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  28.53 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4201  coenzyme F390 synthetase-like  27.55 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0133  Phenylacetate--CoA ligase  26.09 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0426675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  28.4 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  29.71 
 
 		 433 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  34.34 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1877  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.25 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  28.18 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  24.03 
 
 		 472 aa  100  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  27.98 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  25.79 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2152  Phenylacetate--CoA ligase  29.46 
 
 		 446 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  28.02 
 
 		 428 aa  99  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  27.76 
 
 		 433 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  27.49 
 
 		 447 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  27.98 
 
 		 436 aa  97.8  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  26.44 
 
 		 423 aa  97.4  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.72 
 
 		 436 aa  97.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  27.79 
 
 		 432 aa  97.1  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  27.96 
 
 		 430 aa  96.7  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  27.16 
 
 		 433 aa  96.7  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02970  possible capK protein  22.89 
 
 		 435 aa  96.7  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  28.31 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  26.52 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3406  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.74 
 
 		 478 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  27.22 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  28.66 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  28.16 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  23.77 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  27.3 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  24.42 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4415  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.48 
 
 		 480 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.992937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  27.19 
 
 		 435 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  26.59 
 
 		 433 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  26.8 
 
 		 433 aa  94.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  26.28 
 
 		 433 aa  94.4  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  31.87 
 
 		 466 aa  94.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  26.3 
 
 		 433 aa  94  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  26.75 
 
 		 436 aa  94  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>