More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0441 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 468 aa  976    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  35.39 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.64 
 
 		 475 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  33.33 
 
 		 464 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  36.32 
 
 		 416 aa  263  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.45 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4415  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.23 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.992937  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.19 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  28 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  25.45 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2156  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.1 
 
 		 459 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  25.98 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  26.13 
 
 		 480 aa  143  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  25.68 
 
 		 459 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0472  putative capK protein  28.09 
 
 		 459 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000021402  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  25.63 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  24.82 
 
 		 461 aa  133  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.38 
 
 		 454 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  23.98 
 
 		 446 aa  123  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  23.08 
 
 		 441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3406  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.98 
 
 		 478 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  23.06 
 
 		 448 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  23.61 
 
 		 469 aa  120  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  24.95 
 
 		 463 aa  120  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  23.2 
 
 		 450 aa  120  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  23.38 
 
 		 475 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.23 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  22.95 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0807  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.46 
 
 		 452 aa  111  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.316461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  24.01 
 
 		 466 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  27.47 
 
 		 467 aa  107  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  24.63 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  24.94 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  27.04 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.77 
 
 		 436 aa  96.3  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  24.86 
 
 		 437 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  24.93 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  25.12 
 
 		 433 aa  93.2  8e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  23.54 
 
 		 461 aa  93.2  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  22.76 
 
 		 502 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  24.34 
 
 		 444 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  24.88 
 
 		 433 aa  91.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  24.66 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  24.48 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  24.51 
 
 		 433 aa  89.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  23.65 
 
 		 434 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  24.46 
 
 		 432 aa  86.7  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  23.89 
 
 		 433 aa  86.7  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3140  hypothetical protein  22.16 
 
 		 447 aa  86.7  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  22.6 
 
 		 434 aa  86.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0111  capsular polysacharride biosynthesis gene, putative  28.84 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000821148 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00696  hypothetical protein  24.34 
 
 		 417 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  22.41 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  24.44 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  23.64 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  23.37 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  25.36 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  24.71 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  25.53 
 
 		 448 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  25.39 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2125  phenylacetate-CoA ligase  23.21 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  23.93 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  20.69 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  23.66 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  24.46 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  24.07 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  22.9 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  22.64 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  24.06 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.23 
 
 		 436 aa  80.5  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  22.84 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4305  CapK domain-containing protein  23.75 
 
 		 481 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  26.15 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5790  phenylacetate--CoA ligase  23.34 
 
 		 416 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  23.08 
 
 		 445 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  24.1 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  26.89 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  23.23 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  23.36 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3276  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.82 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  21.26 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  21.9 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  22.2 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  24.77 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1877  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.88 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  22.76 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  24.36 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.96 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  24.52 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2883  phenylacetate-CoA ligase  23.47 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  24.92 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  24.72 
 
 		 432 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  23.84 
 
 		 434 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  21.86 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  22.49 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  21.02 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  24.07 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  23.73 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>